Acute Enteric Infections Polymerase Chain Reaction Assay in Pediatric Practice: Opportunities and Challenges

Abstract

Резюме. Изучена этиологическая структура острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных с диа-реей в детский инфекционный стационар, с целью оценки возможностей совершенствования этиологической расшифровки заболеваний при дополнении традиционных бактериологических методов ПЦР-диагностикой с применением отечественных мульти-прайм ПЦР-реагентов. Использовали 4 набора реагентов, обеспечиваю-щих одновременную индикацию нескольких патогенов в одной пробе: 1) Rotavirus, Norovirus, Astrovirus; 2) Shigella spp./EIEC, Salmonella spp., Campylobacter spp.; 3) Yersinia enterocolitica и Yersinia pseudotuberculosis; 4) Escherichia coli: EIEC (энтероинвазивные), EPEC (энтеропатогенные), ETEC (энтеротоксигенные), EHEC (энтерогеморраги-ческие), EAgEC (энтероаггрегативные). Показано, что этиологическая диагностика вирусных диарей увели-чивается на 14%, бактериальных -в 2,5 раза. ПЦР-диагностика выявила у 62% пациентов вирусную природу гастроэнтеритов: Rotavirus (52%), Norovirus (9%), Astrovirus (1%). Количество выявленных ПЦР-маркеров бак-териальных возбудителей ОКИ оказалось в 2,5 раза больше, чем по данным бактериологического исследова-ния. Спектр выявляемых бактериальных агентов увеличился за счет E. coli и Y. enterocolitica. ПЦР-диагностика в 2 раза повысила выявляемость Campylobacter spp. и оказалась единственно эффективным методом детекции ДНК E. сoli в пробах испражнений: доминировали EPEC -66%, EAgEC, ETEC и EHEC составили 31, 9 и 4% соответственно, которые не могли быть идентифицированы при бактериологическом исследовании. ДНК Campylobacter spp. и E. coli в сумме составляли 2 / 3 находок среди бактериальных возбудителей: Campylobacter spp. (41%), E. coli (24%), Salmonella spp. (19%), Yersinia spp. (11%), Shigella spp./EIEC (5%). Положительные результаты бактериологического посева проб испражнений и серологического исследования крови в РНГА дублировали положительные результаты ПЦР-диагностики. В целом, положительные результаты ПЦР-диагностики бак-териальных патогенов установлены у 46,35% обследованных пациентов. У 53,65% пациентов выявлены ПЦР-маркеры ОКИ смешанной этиологии, в основном вирусно-бактериальной, из них в 48,4% случаях выявлены 19 различных вариантов ассоциаций. 12 вариантов бактериальных ассоциаций обнаружены в 5,25%, из них у 11% обнаружены ДНК 2-3 возбудителей бактериальных ОКИ. Проведенное исследование расширило наши Адрес для переписки: Соколова Екатерина Дмитриевна 192289, Санкт-Петербург, ул. Бухарестская, 134, Детская городская клиническая больница № 5 им. Н.Ф. Филатова.

Gastroenterological masks of chronic yersiniosis in children: comprehension of experience

“…ПЦР является высокочувствительным ускоренным диагностическим методом и в настоящее время все чаще рассматривается как «золотой стандарт» прямых методов этиологической диагностики, в частности, при острых кишечных инфекциях, отбирая первенство у бактериологических исследований [13,16,17].…”