Однолетняя бобовая культура гуар (Cyamopsis tetragonoloba (L.) Taub.) перспективна для выращивания на юге России. В 2018 г. были проведены фитосанитарные обследования посевов гуара (13 коллекционных образцов) в пяти филиалах ВИР (Краснодарский край, Дагестан, Астраханская и Волгоградская области). Во всех пунктах на листьях гуара отмечено несколько типов листовых пятнистостей, среди которых преобладали симптомы поражения растений грибами рода Alternaria Nees. Видовой состав микромицетов идентифицировали с помощью микробиологических методов и высокопроизводительного секвенирования последовательности межгенного спейсера гена ядерной рибосомальной РНК (ITS2). Установлено, что грибы Alter naria spp. в различных эколого-географических условиях юга России вызывают два основных типа пятнистостей листьев: типичную (бежевые и бурые округлые пятна, обычно сопровождающиеся концентрической зональностью) и коричневую пятнистость (мелкие бурые выпуклые сливающиеся пятна). В большинстве случаев поражение тканей листа вызвано грибом A. tenuissima (Nees & T. Nees : Fr.) Wiltshire. Выявлена также сопутствующая микофлора (прежде всего, грибы рода Fusarium Link). Один из самых вредоносных патогенов гуара в странах, где сосредоточены основные посевные площади (Индия, Пакистан, США),-специализированный микромицет A. cyamopsidis Rangaswami & A.V. Rao на посевах в России не обнаружен. Образцы гуара различаются по степени поражения возбудителем альтернариоза A. tenuissima. Показано дифференциальное взаимодействие паразита и хозяина. Соответственно, для предотвращения эпифитотий следует выращивать сорта, защищенные нетождественными генами устойчивости. Во всех пунктах изучения слабо поражались альтернариозом образцы к-52568 (Аргентина) и к-52569 (Пакистан), ряд образцов был устойчив только в условиях одной или двух опытных станций. Изученные формы гетерогенны по устойчивости к патогену, что предоставляет возможность отбора резистентных к болезни линий из большей части коллекционных образцов. Так, в различных филиалах ВИР из образцов к-52571, к-52573 и к-52580 отобраны растения без симптомов поражения, собран семенной материал, который может быть использован для создания новых доноров устойчивости к болезни. Ключевые слова: гуар; фитосанитарный мониторинг; альтернариоз; высокопроизводительное секвенирование (NGS); устойчивость; взаимодействие паразит-растение-хозяин.