Analisis Marka Gen Patogenik iutA Escherichia Coli Penyebab Colibasilosis pada Ayam Buras

Abstract

Kolibasilosis merupakan penyakit menular pada ayam yang disebabkan oleh Avian Pathogenic Escherichia coli (APEC). Kemampuan APEC untuk menyebabkan penyakit tergantung pada banyak faktor patogen, salah satunya adalah gen patogenik iutA. Penelitian bertujuan untuk mengetahui sekuen DNA gen iutA APEC di Bali serta kekerabatannya dengan gen iutA dari negara lain. Penelitian ini menggunakan dua isolat APEC asal ayam buras di Kabupaten Tabanan dan Badung yang telah dimurnikan dan tersedia di Laboratorium Bakteriologi Fakultas Kedokteran Hewan, Universitas Udayana. DNA isolat diisolasi dengan Chelex 10%. Produk polymerase chain reaction (PCR) disekuensing di First Base Laboratories Malaysia dengan metode Sanger’s dideoxy nucleotide termination. Kedua hasil sekuen gen iutA memiliki homologi 100% dengan panjang 250 bp. Analisis filogenik dengan 58 data gen iutA di Escherichia coli dan bakteri lain di dunia memiliki 43 situs polimorfik pada tingkat asam nukleat dan 13 di tingkat asam amino. Gen iutA asal Bali berada di dalam satu kelompok dengan gen iutA asal Brazilia (KP657535) tahun 2011, Jerman (LT599825) tahun 2016, dan Cina (CP033635) tahun 2016. Gen ini dapat digunakan sebagai marker patogenik APEC di Indonesia.

Identification and Pathogenicity of Escherichia coli from Cloacal Swabs

“…Escherichia coli patogen mempunyai peranan penting dalam penyakit zoonosis yang bisa menyebar melalui kontak langsung dengan feses, kontak dengan peralatan kandang, air dan makanan yang terkontaminasi seperti makanan yang mentah atau daging yang dimasak kurang matang (Pelt et al, 2016). Selain itu juga meningkatnya kejadian penyakit yang disebabkan oleh E. coli seiring dengan rendahnya sanitasi perkandangan (Besung et al, 2019). Karakteristik E. coli yang dapat menyebabkan penyakit yaitu bersifat patogen, karena itu penelitian ini bertujuan untuk identifikasi dan uji patogenesitas E. coli dari swab kloaka ayam.…”

Analisis Marka Gen Patogenik hlyF pada Escherichia coli Penyebab Kolibasilosis pada Ayam Buras

“…Hasil kajian gen pada penelitian ini juga berbeda dengan kajian marka patogenik APEC lainnya, yaitu gen iroN (Gunawan, 2019) dan iutA (Marhendra, 2019). Kemungkinan bahwa ketiga gen tersebut dapat dibawa oleh plasmid yang berbeda sehingga mempunyai pola filogeni yang berbeda.…”