Introducción: la apolipoproteína E (APOE) es una glicoproteína implicada en el transporte de moléculas lipídicas. Se han descrito tres alelos del gen APOE: Ɛ2, Ɛ3 y Ɛ4. Varios estudios demuestran asociación de la isoforma APOE4 con Alzheimer de inicio tardío. Objetivos: determinar las frecuencias genotípicas y alélicas del gen APOE en una muestra de adultos en Bogotá. Materiales y métodos: estudio observacional descriptivo de corte transversal. A partir de una muestra de sangre periférica se extrajo ADN genómico y se realizó PCR-Tetraprimer para la determinación de los alelos de APOE. Resultados: se incluyeron 1.254 sujetos, 942 mujeres (75%) y 312 hombres (25%) con edades entre 40 y 100 años. El alelo más frecuente fue el Ɛ3 (85%), seguido por Ɛ4 (11%) y Ɛ2 (2%). De la población que manifestó tener ascendencia cundiboyacense, 567 sujetos (74.6%) presentaban el genotipo Ɛ3/Ɛ3, mientras que 156 (20.4%) el Ɛ3/Ɛ4, 23 (3%) el Ɛ2/Ɛ3, 11 (1.5%) el Ɛ4/Ɛ4, y 4 (0.5%) el Ɛ2/Ɛ4. Los individuos con genotipo Ɛ2/Ɛ2 manifestaron no conocer el dato de ascendencia. Conclusiones: las frecuencias alélicas y genotípicas de APOE varían según el origen étnico, sin embargo es posible la identificación de sujetos con el genotipo menos frecuente (Ɛ2/Ɛ2) al analizar muestras de mayor tamaño. En los reportes previos en el país no se ha descrito el genotipo Ɛ2/Ɛ2, el cual fue identificado en la presente muestra como el de menor proporción.