Comparative Analysis of Methods for Identification of Nontuberculous Mycobacteria Isolated From Clinical Material

Abstract

Резюме. В последнее время наблюдается значительный рост заболеваемости микобактериозами, который об-условлен увеличением доли иммуносупрессированных пациентов, наличием у них различных коморбидных состояний, а также совершенствованием методов диагностики. Выбор наиболее точного метода идентифи-кации является крайне важным в определении тактики лечения пациентов. Цель исследования -провести сравнительный анализ современных методов идентификации НТМБ, выделенных из клинического мате-риала в 2015 г. в Самарской области. В работе проводилась идентификация 78 штаммов микроорганизмов. Лабораторная диагностика проводилась с использованием метода ДНК-гибридизации и методом MALDIToF масс-спектрометрии. Результаты. При идентификации микроорганизмов с использованием MALDIToF масс-спектрометрии было выделено 16 штаммов (20,5%) M. kansasii; по 11 штаммов (14,1%) M. avium и M. fortuitum; 9 штаммов (11,5%) M. gordonae; по 3 штамма (3,8%) M. peregrinum, M. szulgai, M. chimera intracellulare group, по 2 штамма (2,6%) M. abscessus, M. septicum, M. paragordonae, M. senegalence, по 1 штамму (1,3%) M. chelonae, M. frederiksbergense, M. monacense, M. lentiflavum. При использовании метода масс-спектрометрии было иден-тифицировано 15 видов НТМБ, методом ДНК-гибридизации -9 видов. Полное совпадение результатов идентификации было отмечено всего у 45 (57,7%) штаммов, несовпадающие результаты выявлены у 16 штам-мов (20,5%). Наиболее часто при использовании метода ДНК-гибридизации несовпадение было выявлено у медленнорастущих культур (9 штаммов) с преобладанием микроорганизмов, идентифицированных как M. gordonae. Среди представителей быстрорастущих НТМБ было выявлено 7 расхождений в идентифика-ции, более часто среди представителей групп M. fortuitum и M. peregrinum. Особое внимание стоит обратить на идентификацию штамма M. kansasii молекулярно-генетическим методом, который масс-спектрометрией был определен как M. bovis. Обе культуры M. tuberculosis complex, которые были идентифицированы при по-мощи MALDI-ToF спектрометрии, ДНК-гибридизацией не были определены до вида. 17 (21,8%) штаммов микроорганизмов, которые не были идентифицированы при использовании метода ДНК-гибридизации, идентифицированы с помощью спектрометрии, включая медленнорастущие микроорганизмы, не относя-щиеся к микобактериям 7 штаммов (9,0%): Gordonia rubriperticta, Nocardia forcinica, Tsukumurella spp., Rhodotorula mucilaginosa. Точная видовая идентификация НТМБ является основополагающей для определения тактики лечения пациентов с микобактериозами. Возможности идентификации нетуберкулезных микобактерий с ис-пользованием метода ДНК-гибридизации являются недостаточными на сегодняшний день. Внедрение новых методов, таких как MALDI-ToF спектрометрия, позволяет идентифицировать большее количество видов не-Адрес для переписки: Лямин Артем Викторович 443079, Россия, г. Самара, ул. Гагарина, 18. Тел