Introdução: Os profissionais da saúde estão entre a população exposta ao vírus da COVID-19 de forma direta, devido ao seu trabalho, na assistência e no cuidado que dispensam às pessoas infectadas. Objetivos: analisar aspectos da saúde e segurança de trabalhadores da Atenção Primária em municípios do sul do Brasil, no contexto da pandemia da COVID-19. Materiais e métodos: pesquisa quantitativa e transversal, realizada a partir de um estudo de base populacional. Os participantes foram profissionais de saúde da Atenção Primária de 13 municípios do interior do Rio Grande do Sul/Brasil. A coleta de dados ocorreu em 2020, através de um questionário previamente estruturado composto por 34 perguntas fechadas. As informações foram analisadas através do programa Jasp, onde avaliou-se frequências absolutas e relativas. Resultados: a análise evidenciou que os profissionais da Atenção Primária que compuseram este estudo têm condições laborais adequadas, bem como locais de trabalhos com condições favoráveis, no contexto da pandemia, isto é, possuem infraestrutura e equipamentos de proteção à saúde (EPI) em quantidade adequada. Foram mencionados a criação de novos fluxos pela gestão e o estabelecimento de novas rotinas durante os atendimentos em saúde. Devido à situação pandêmica, alguns profissionais precisaram afastar-se por contaminação, bem como, questões de saúde mental. Conclusões: Evidenciou-se a adesão dos trabalhadores às medidas de prevenção e o uso correto dos EPI durante a pandemia, bem como, a análise de diversos municípios possibilitou situações de trabalho distintas.