La matriz productiva ecuatoriana y su oferta exportable se han caracterizado históricamente por productos sin transformación sustancial, en el presente trabajo a través del estudio de subpartidas arancelarias en PyMEs de alimentos registradas en la ciudad de Quito, Ecuador, se identificará la existencia o no de innovación de producto mediante el análisis de nuevas subpartidas exportadas o exportaciones realizadas hacía un nuevo mercado en el periodo comprendido entre el 2019 y 2023, las industrias seleccionadas fueron aquellas que tienen relación en su CIIU con la producción de alimentos, no se tomó en cuenta bebidas, bebidas alcohólicas, ni tabaco. Los resultados obtenidos demostraron la existencia de innovación de producto en las PyMEs de Quito, sin embargo, no fueron significativos por el bajo porcentaje de empresas que innovaron en sus exportaciones. Es importante que el sector público active mecanismos para incentivar la innovación como financiamiento, capacitaciones, clúster, atracción de IED, entre otros.