Easy Development and Integration of Science Gateways with Vine Toolkit

Kurowski, Krzysztof; Dziubecki, Piotr; Grabowski, Piotr; Krysiński, Michał; Piontek, Tomasz; Szejnfeld, Dawid

doi:10.1007/978-3-319-10894-0_11

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“…A própria criação e desenvolvimento de gateways científicos conta com ferramentas de automatização. O Vine Toolkit provê APIs de criação de aplicações Web que ocultem complexidade (KUROWSKI et al, 2014). O SAGA oferece uma especificação para criação de interfaces de integração com aplicações (GOODALE et al, 2007).…”

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“…A facilidade de uso é o papel crucial a ser desempenhado pelos gateways. Tipicamente, isso é conseguido nas camadas de serviço no topo da infraestrutura a que estão conectados (KUROWSKI et al, 2014). Os primeiros gateways científicos focavam na computação em grade (WASSERMANN et al, 2007), que compartilham recursos e criam comunidades por meio de organizações virtuais (KACSUK, 2011).…”

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MDAPSP - Uma arquitetura modular distribuída para auxílio à predição de estruturas de proteínas

Oliveira¹

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Agradeço primeiramente à minha família pela paciência, compreensão e apoio desde sempre. Ao prof. Júlio pelas oportunidades e pela orientação nessa caminhada acadêmica. Agradeço aos demais professores que contribuíram para minha formação e desenvolvimento dessa pesquisa, àqueles que integram o LaSDPC, ao prof. Alexandre Delbem pela colaboração e ao prof. Stephan Reiff-Marganiec pela orientação no período na Universidade de Leicester-Inglaterra. Aos meus amigos, dos quais destaco quatro que auxiliaram diretamente na construção dessa tese, Alexandre Defelicibus, Fausto Costa, Mário Pardo e Juliano Ferreira. Aos companheiros de laboratório pelas conversas, risadas e trocas de conhecimento. Aos amigos com quem convivi nesses anos, compartilhando teto, experiências, alegrias e dificuldades. Aos amigos de toda a vida de Machado, Poços de Caldas, São Carlos, Leicester e demais lugares que tive o prazer de conhecer. Muito obrigado. "O que sabemos é uma gota, o que ignoramos é um oceano." (Isaac Newton) Palavras-chave: Arquiteturas orientadas a serviço, predição de estruturas de proteínas, gateways científicos, workflows científicos, WorkflowSim.

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