Efeito de tipos de acasalamentos e razões sexuais na seleção baseada no BLUP

Cunha, Elizângela Emídio; Euclydes, Ricardo Frederico; Torres, Robledo de Almeida; Lopes, Paulo Sávio; Júnior, José Ivo Ribeiro; Carneiro, Pedro Crescêncio Souza

doi:10.1590/s1516-35982003000600003

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“…De maneira geral, as populações selecionadas pelo BLUP foram as que apresentaram maiores coeficientes de endogamia, corroborando os resultados encontrados por Cunha et al (2003) e Quinton et al (1992). A seleção baseada em estimativas de valores genéticos por meio do BLUP com o modelo animal geralmente conduz a incrementos na taxa de endogamia, pois animais aparentados possuem valores genéticos similares (Caballero et al, 1996;Queiroz et al, 2000).…”

Section: Resultsunclassified

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Endogamia e limite de seleção em populações selecionadas obtidas por simulação

Breda

Euclydes²,

Pereira

et al. 2004

R. Bras. Zootec.

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RESUMO -Objetivou-se, com este trabalho, avaliar o comportamento do coeficiente de endogamia e do limite de seleção considerando população-base selecionada. Utilizou-se o programa GENESYS para a simulação do genoma constituído de uma única característica quantitativa com valor de herdabilidade igual a 0,40, população-base, população inicial e populações sob seleção. Foram consideradas três gerações distintas como gerações bases, gerações zero (G 0 PB), três (G 3 PB) e sete (G 7 PB). As populações foram selecionadas a partir dos valores genéticos obtidos pelo melhor preditor linear não-viesado (BLUP) e com base no desempenho individual, sendo considerados: a) dois tamanhos efetivos de população (N e1 = 38,09 e N e2 = 88,88) e b) dois sistemas de acasalamentos dos reprodutores selecionados (reprodutores acasalados aleatoriamente -RAA e exclusão de irmãos completos -EIC). Os parâmetros avaliados foram: coeficiente médio de endogamia, percentagem de locos fixados favoravelmente e limite de seleção. A não-utilização da população-base verdadeira (G 0 PB) subestimou os coeficientes de endogamia. As populações que utilizaram as gerações três e sete como base apresentaram as mesmas taxas de fixação de alelos favoráveis e os mesmos valores do limite de seleção das populações que consideraram a G 0 PB.Palavras-chave: endogamia, população base, seleção, tamanho efetivo da população Inbreeding and Selection Limit in Selected Population Obtained by SimulationABSTRACT -Objective was to evaluate the behavior average inbreeding coefficient associated to the selection limit considering selected population as base population. GENESYS program was used for simulation of the genome (one trait of h 2 = 0.40), base population, initial population and populations under selection. Three different generations were considered as base generations, zero (G 0 PB), three (G 3 PB) and seven (G 7 PB). Populations were selected based on best linear unbiased predictor (BLUP) and on individual phenotype in which were considered: a) two effective population sizes (N e1 = 38.09 and N e2 = 88.88) and b) two mating systems (random mating -RAA and exclusion of full sibs -EIC). Evaluated parameters were: average inbreeding coefficient, fixation of favorable alleles and selection limit. Selected populations considered as true base population resulted in underestimated inbreeding coefficient. Populations that used generations three and seven as true base population presented the same rates of fixation of favorable alleles and the same values for selection limit as those of populations that considered G 0 PB. Key Words: inbreeding, base population, selection, population effective sizes R. Bras. Zootec., v.33, n.6, p.2017-2025, 2004 (Supl. 2) 1 Parte da tese de mestrado apresentada à UFV, para obtenção do título de mestre. Apoio CNPq. IntroduçãoA endogamia é um sistema de acasalamento em que os indivíduos mais aparentados entre si que a média da população são utilizados como pais da próxima geração. Tem como principal efeito genético o aumento da homozigose ...

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Section: Resultsunclassified

“…Caballero et al (1996), Queiroz et al (2000) e Cunha et al (2003) reportaram que, nas populações selecionadas pelo BLUP, existe melhor acurácia de seleção, favorecendo a fixação de alelos favoráveis, além de aumento do peso atribuído à informação de família, que acabam por elevar a taxa de endogamia.…”

Section: Geraçãounclassified

Endogamia e limite de seleção em populações selecionadas obtidas por simulação

Breda

Euclydes²,

Pereira

et al. 2004

R. Bras. Zootec.

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“…1378, 2012 intensidade e a acurácia da seleção, o método de seleção utilizado, o tempo total de seleção, os sistemas de acasalamentos praticados, além do conhecimento da própria característica considerada na seleção, são fundamentais. Na maioria das vezes estes fatores relacionam-se, e, não raramente, há entre eles relações antagônicas (MUIR, 1997;CUNHA et al, 2003), que dificultam a otimização do processo de seleção. BLUP levar a uma maior endogamia do que, por exemplo, a seleção massal (baseada no próprio fenótipo).…”

Section: Avaliação Genética E Seleçãounclassified

“…BLUP levar a uma maior endogamia do que, por exemplo, a seleção massal (baseada no próprio fenótipo). Consequentemente, a longo prazo, uma maior endogamia leva a perda de variação genética e, possivelmente, haverá depressão endogâmica e redução do ganho genético (QUEIROZ et al, 2000;CUNHA et al, 2003).…”

Section: Avaliação Genética E Seleçãounclassified

Seleção assistida: proposta de otimização utilizando Algoritmos Genéticos

Santos¹,

Sarmento²,

Campêlo³

et al. 2016

Pubvet

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ResumoO avanço da computação e da informatização tem influenciado os procedimentos de avaliação genética, permitindo, com isso, comparações de méritos genéticos dos animais entre rebanhos, raças ou países. O fenômeno da convergência de tecnologias deixa explicita a importância dos sistemas de informações gerenciais frente a manipulação da enorme quantidade de dados oriundos de vários tipos de integrações na busca de melhores respostas. Em função disso, neste artigo são apresentadas e discutidas algumas tendências e aplicações de algoritmos evolucionários focando-se a otimização da seleção de animais para acasalamentos assistidos no melhoramento animal. Este trabalho

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“…Esse resultado era esperado e destaca a importância do uso de acasalamentos controlados, com restrição aos acasalamentos entre irmãos, principalmente para populações de menor tamanho efetivo (TE3). Cunha (2003) observou que à medida que a razão sexual aumenta, ocorre menor distinção entre os tipos de acasalamento e redução no número de gerações para se atingir os valores fenotípicos de estabilização. Tais fatos podem estar associados ao decréscimo observado no tamanho efetivo de populaFigura 3.…”

Section: Perdas Por Fixaçãounclassified

Comparação de métodos de seleção em populações simuladas de frangos de corte

Oliveira

Cunha

Carneiro

et al. 2005

Pesq. agropec. bras.

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Resumo -Populações de frangos de corte foram simuladas utilizando-se o programa GENESYS, com o objetivo de avaliar a seleção com base no método da melhor predição linear não-viesada (BLUP -best linear unbiased prediction), a seleção individual para três tamanhos efetivos de população e três sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados. Simulou-se um genoma constituído de uma característica quantitativa, com valor de herdabilidade igual a 0,30, em seleção praticada durante 15 gerações consecutivas, com 30 repetições por geração. Para um mesmo tamanho efetivo e sistema de acasalamento, o BLUP foi sempre superior à seleção individual nas 15 gerações de seleção avaliadas.Termos para indexação: BLUP, seleção individual, sistemas de acasalamento, tamanho efetivo de população. Comparison of selection methods in simulated populations of broilersAbstract -Populations of broilers were simulated by using the program Genesys, in order to evaluate the selection based on BLUP (best linear unbiased prediction), and the individual selection for three effective population sizes, and three mating systems of the selected reproducers. The simulated genome was constituted by a quantitative trait, which had heritability of 0.30, in a selection made during 15 consecutive generations, and 30 cycles for generation. BLUP was always superior to the individual selection during all generations evaluated with the same effective size and mating system. Index terms: BLUP, individual selection, mating systems, effective population size. IntroduçãoA avicultura é a atividade agropecuária que apresenta os maiores índices de evolução no desempenho produtivo nas últimas décadas. Nesse contexto, não resta dúvida de que o melhoramento genético das aves contribui, de forma expressiva, para o progresso alcançado.No melhoramento animal, deve-se sempre obter material genético produtivo a custo mais baixo, o que pode proporcionar lucro e sobrevivência num mercado competitivo. Para isso, nos programas de melhoramento, é preciso conhecer a eficiência de cada método de seleção e empregar o que resulte em maiores ganhos com menores custos. Nesse sentido, a simulação de populações tem sido muito usada pelos melhoristas, principalmente na comparação de métodos de seleção, pois seus custos são bastante reduzidos e sua utilização justificável, nas situações em que a obtenção de dados reais seria impossível (Torres Júnior, 1996).A resposta à seleção para uma única característica depende da variabilidade genética, intervalo de geração, acurácia e intensidade de seleção e tamanho efetivo da população. Segundo Caballero (1994), o tamanho efetivo da população é a chave no processo evolutivo e na genética quantitativa, pois fornece a medida da taxa de oscilação genética e endogamia numa população. Quinton et al. (1992) avaliaram métodos de seleção, sob mesma taxa de endogamia, e concluíram que a seleção com base no fenótipo apresentou melhores respostas do que os outros métodos de seleção estudados, quando o objetivo foi manter baixa a taxa de endogamia (1% po...

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Efeito de tipos de acasalamentos e razões sexuais na seleção baseada no BLUP

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Endogamia e limite de seleção em populações selecionadas obtidas por simulação

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