Efetividade do GeneXpert® no diagnóstico da tuberculose em pessoas que vivem com HIV/aids

Abstract

OBJETIVO Identificar e sintetizar o conhecimento científico produzido a respeito da efetividade do teste GeneXpert no diagnóstico da tuberculose (TB) pulmonar em pessoas vivendo com HIV/aids. MÉTODOS Revisão integrativa da literatura, cuja busca foi feita nas plataformas Embase, Scopus, PubMed, Cinahl, Academic Search Premier, Socindex e Lilacs, em dezembro de 2019. Os estudos levantados passaram por duas etapas de seleção: leitura dos títulos e resumos por dois revisores de forma independente, utilizando a plataforma Rayyan e leitura integral dos mesmos. Foram incluídos 19 estudos primários em inglês, português e espanhol que respondiam à pergunta norteadora do estudo: Qual é a efetividade do teste GeneXpert no diagnóstico da TB pulmonar em pessoas que vivem com HIV/aids? RESULTADOS A utilização do GeneXpert aumentou substancialmente a detecção de casos de TB entre a população coinfectada com HIV, com sensibilidade que variou de 68% a 100%, sendo superior à baciloscopia. A especificidade variou de 91,7% a 100%; o valor preditivo positivo, de 79,2% a 96,1%; e o valor preditivo negativo, de 84,6% a 99,3%, valores considerados semelhantes à baciloscopia pela maioria dos estudos. O teste também foi comparado com as diferentes formas de realização da cultura e outros testes moleculares, sendo considerado inferior apenas ao Xpert Ultra. CONCLUSÃO É possível afirmar que locais com alta incidência de HIV se beneficiariam com a implantação do teste GeneXpert, uma vez que sua efetividade no diagnóstico da TB pulmonar nessa população é expressiva quando comparada à baciloscopia, teste que foi por muito tempo amplamente utilizado para a detecção dos casos.

Targeted Chromosomal Barcoding Establishes Direct Genotype-Phenotype Associations for Antibiotic Resistance in Mycobacterium abscessus

“…In the era of whole-genome sequencing, exploring genome data from clinical isolates is useful to generate datasheets of putative antibiotic resistance polymorphisms. In this same context, PCR-based commercial systems to detect these polymorphisms are widely available for M. tuberculosis ( 30 – 32 ), although their introduction into nontuberculous mycobacteria is far from optimal. However, these genomic methods have previously required establishing a direct link between chromosomal polymorphisms and antimicrobial resistance, and this has been otherwise the result of long-term observation and characterization of clinical isolates.…”

Access the Diagnostic Accuracy of GeneXpert to Detect <em>Mycobacterium tuberculosis</em> and Rifampicin-Resistance Tuberculosis among Presumptive Tuberculosis and Presumptive Drug Resistant Tuberculosis Patients

“…In countries with low endemicity rates, the sensitivity and the specificity of Xpert MTB/RIF vary between 82, 95, and 98% for sensitivity and 96 and 99% for specificity. However, in countries with high endemicity, these rates vary between 80 and 88% for sensitivity and between 95 and 98% for specificity [26][27][28].In another study, Faria et al [29] reported Xpert MTB/RIF assay's sensitivity ranging from 68% to 100%. Specificity ranged from 91.7% to 100%, the positive predictive value from 79.2% to 96.1%, and the negative predictive value from 84.6% to 99.3%.…”

Assess the Diagnostic Accuracy of GeneXpert to Detect Mycobacterium tuberculosis and Rifampicin-Resistant Tuberculosis among Presumptive Tuberculosis and Presumptive Drug Resistant Tuberculosis Patients

“…However, in countries with high endemicity, these rates vary between 80% and 88% for sensitivity and between 95 and 98% for specificity [30][31][32]. In another study, Faria et al [33] reported that the sensitivity of the GeneXpert MTB/RIF assay ranges from 68% to 100%. Specificity ranged from 91.7% to 100%, the positive predictive value from 79.2% to 96.1%, and the negative predictive value from 84.6% to 99.3%.…”