Estudos de Modelagem Comparativa da lanosterol 14-alfa demetilase de Moniliophthora perniciosa

Abstract

Moniliophthora perniciosa is the causative agent of witches' broom, which affects the Theobroma cacao, causing great losses in cocoa production. The integrated management techniques available allow controlling the pest only partially. An important strategy to contain the witches' broom is to study the interactions of the enzyme lanosterol 14α-demethylase (CYP51) of Moniliophthora with azole compounds. These compounds block the synthesis of ergosterol and consequently the fungal growth by the connection between the iron atom in the cofactor of this enzyme and the nitrogen atom of the azole. However, there is no study on the interaction of these compounds with the enzyme lanosterol 14α-demethylase of this pathogen. In this work, a model of the enzyme lanosterol 14α-demethylase of M. perniciosa was created by comparative modeling techniques. Then, the spatial arrangement of residues that comprise the catalytic site of the enzyme was identified. The results obtained are in agreement with the RESUMOMoniliophthora perniciosa é o agente causador da vassoura de bruxa, que afeta o Theobroma cacao, causando grandes perdas na produção de cacau. As técnicas de gestão integrada desenvolvidas permitem controlar a praga apenas parcialmente. Uma estratégia importante para conter a vassoura de bruxa é estudar as interações da enzima lanosterol 14α-demethylase (CYP51) de Moniliophthora com compostos azólicos. Estes compostos bloqueiam a síntese de ergosterol e, consequentemente, o crescimento fúngico pela ligação entre o átomo de ferro do cofactor dessa enzima e o átomo de nitrogênio do grupo azol. No entanto, não há um estudo sistemático sobre a interação destes compostos com a enzima lanosterol 14α-demetilase deste patógeno. Neste trabalho, um modelo da enzima lanosterol 14α-demetilase do M. perniciosa foi criado por técnicas de modelagem comparativa. Em seguida, o arranjo espacial dos resíduos que formam o sítio catalítico da enzima foi identificado. Os resultados mostram que o modelo construído pode ser empregado em estudos de ancoragem molecular e de novo design. Palavras-chave:Moniliophthora perniciosa, modelagem molecular, compostos azóis, CYP51.

Modelagem e docking molecular da glutationa s-transferase epsilon 2 de aedes aegypti: possíveis implicações na resistência a inseticidas químicos.

“…A sequência primária da AaGSTE2 , 1997;ARNOLD et al, 2006;KIEFER et al, 2009), foi realizada a modelagem da AaGSTE2. O SWISS MODEL trata-se de uma ferramenta online que utiliza a técnica de corpos rígidos para a construção do modelo (PACHECO, 2009). As coordenadas atômicas do template foram salvos em arquivo .pdb pra posterior análise da qualidade estrutural.…”

“…Este utiliza para a avaliação informações de estruturas resolvidas e com resolução de 2.0 Å (LASKOWSKI et al, 1993). A avaliação estereoquímica da estrutura é baseada em cima de diversos parâmetros, como: ângulos torcionais das cadeias laterais, da cadeia principal, interações entre átomos, energias das ligações de hidrogênio, entre outros (PACHECO, 2009).…”