First report on molecular characterization and phylogenetic analysis of Reticuloendotheliosis virus in Sudan

Alfaki, Shima H.; Hussien, Mohammed; Osman, Nussieba A.; Enan, Khalid A; Hussein, Abdel Rahim M. El

doi:10.1007/s11250-020-02235-4

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“…It is noteworthy to state that several previous studies across the world detected REV sequences integrated in the genomes of field and vaccine strains of FWPV, PGPV, and TKPV [16,17,[31][32][33][34][35][36][37][38][39][40][41][42][43]. Still, no REV full or partial LTRs have never seen integrated in canarypox viruses (CNPVs) [16,17,[31][32][33][34][35][36][37].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…It has been reported that the FWPV vaccines are the cause of REV provirus retention in fowls, but some researchers disagree with this hypothesis, since REV integration was detected in the FWPV genome before the wide spread of the FWPV vaccine in poultry [ 30 ]. It is noteworthy to state that several previous studies across the world detected REV sequences integrated in the genomes of field and vaccine strains of FWPV, PGPV, and TKPV [ 16 , 17 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 ]. Still, no REV full or partial LTRs have never seen integrated in canarypox viruses (CNPVs) [ 16 , 17 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 ].…”

Section: Introductionmentioning

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Molecular Detection of Reticuloendotheliosis Virus 5′ Long Terminal Repeat Integration in the Genome of Avipoxvirus Field Strains from Different Avian Species in Egypt

Mosad

El‐Tholoth

El-Kenawy

et al. 2020

Biology

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Avipoxviruses (APVs) are among the most complex viruses that infect a wide range of birds’ species. The infection by APVs is often associated with breathing and swallowing difficulties, reduced growth, decreased egg production, and high mortalities in domestic poultry. In the present study, 200 cutaneous nodular samples were collected from different avian species (chicken, pigeon, turkey, and canary) suspected to be infected with APVs from Dakahlia Governorate, Egypt. Pooled samples (n = 40) were prepared and inoculated in embryonated chicken eggs (ECEs). APVs were then identified by polymerase chain reaction (PCR) and sequence analysis of the APV P4b gene. Furthermore, the forty strains of APVs were screened for the presence of reticuloendotheliosis virus (REV)-5’LTR in their genomes. Interestingly, the phylogenic tree of the APV P4b gene was separated into 2 clades: clade 1, in which our fowlpox virus (FWPV), turkeypox virus (TKPV), and canarypox virus (CNPV) isolates were grouped, along with reference FWPVs and TKPVs retrieved from GenBank, whereas, in clade2, the pigeonpox virus (PGPV) isolate was grouped with PGPVs retrieved from GenBank. Likewise, REV-5’LTR was amplified from 30 strains isolated from chicken, turkey, and canary, while PGPV strains were free from REV-5’LTR integration. To the best of our knowledge, this study involved the detection and characterization of REV-5’LTR insertions in the APVs field isolates in Egypt for the first time. Given the above information, further future research seems recommended to understand the impact of the resulting REV-5’LTR insertions on the pathogenesis, virulence, and inadequate vaccine protection against APVs.

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Section: Introductionmentioning

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Section: Introductionmentioning

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Molecular Detection of Reticuloendotheliosis Virus 5′ Long Terminal Repeat Integration in the Genome of Avipoxvirus Field Strains from Different Avian Species in Egypt

Mosad

El‐Tholoth

El-Kenawy

et al. 2020

Biology

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“…Assim como outros retrovírus, codifica duas poliproteínas: polimerase (pol), capsídeo (gag), seguido de envelope (env) e é flanqueado por regiões repetitivas longas (LTRs), que atuam como promotores de transcrição (Figura 4) 10,14,35 . A região da polimerase é a região mais conservada do vírus, que codifica as enzimas virais da transcriptase reversa (RT), a protease (PR) e da integrase (IN) que são essenciais para a replicação viral 37,38 e na família dos gammaretrovírus está situada na mesma ORF contínua que também codifica para o gag. A expressão da polimerase aparentemente ocorre através da supressão de terminação de um códon de parada 39 .…”

Section: Genomaunclassified

Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil

Caleiro¹

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Dedico essa dissertação aos meus pais Cléia Santos Caleiro e Cláudio Rui Mateus Caleiro, aos meus irmãos Júlia Santos Caleiro e Daniel Santos Caleiro e ao meu namorado Caio, por acreditarem em mim e a me apoiarem nesse sonho AgradecimentosEm primeiro lugar, gostaria de agradecer a minha orientadora Dra. Camila Malta Romano.Você nesses 10 anos não foi somente o meu exemplo de Cientista, mas também uma amiga a qual me apoiou, me incentivou, me ouviu e me acolheu nos momentos mais difíceis, foi mãe na hora de me puxar as orelhas, de me colocar no caminho de volta e de compreender as minhas limitações sem desistir de mim, inclusive sempre acreditando em mim. Obrigada por ter me aceito lá trás, uma menina recém chegado em São Paulo e me dado essa oportunidade e essa honra de ser sua aluna. Você é e sempre será a melhor orientadora que alguém possa ter! A todos os funcionários do IMT, obrigada pela amizade e por terem me recebido tão bem ao longo desses anos.A Dra. Carla Torre Braconi, obrigada por ter me indicado e apresentado para a Camila.A Dra. Karin Kirchgatter e aos seus alunos, por me ajudarem com os experimentos e por ter cedidos as amostras.A Juliana Summa, ao veterinário Marcos e toda a equipe do DEPAVE -3, pela colaboração e por me auxiliar nas coletas.Ao Dr Jansen pelas preciosas amostras, pela ajuda na qualificação e pela oportunidade de trabalhar juntos no ICB.Aos meus pais Cléia e Cláudio por acreditarem em mim, me apoiarem nessa jornada e acima de tudo, por todo o amor e carinho e por serem a minha inspiração. Aos meu irmãos Júlia e Daniel, por todo amor e carinho.A todos os meus queridos amigos da Santa Funda Elíseos, por terem me dado todo suporte, risadas, admiração pela minha pesquisa e principalmente pela amizade.A minha queria amiga Ana Carolina, obrigada por todos os cafés terapias, pelo apoio e todas as palavras de carinho.A Dra Ester e sua equipe, em especial a Dra Ingra Morales, Dra Jaqueline Goes, Flávia Salles e a Thaís Colete, obrigada pela ajuda, incentivo, carinho e amizade. Aos meus amigos do Viroclub, em especial Heuder, Almir, Layla e Natan obrigada pela amizade, conversas cientificas e ao carinho. Aos meus tios Josineide e Osvaldo, obrigada por me acolherem e a me ajudar em todos os momentos. Sem vocês eu não teria chegado até aqui. Aos meus sogros Celina e Marcos e minha cunhada Andréia por terem me recebido tão bem na família de vocês e por todo o apoio e carinho.Por fim ao melhor namorado Caio Santos de Souza, obrigada por ser tão companheiro, amigo, me fazer rir nos momentos difíceis, por me ajudar nos experimentos, na escrita, em tudo.Você foi fundamental pra eu chegar ate aqui. Amo você.

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Reemergence of reticuloendotheliosis virus and Marek's disease virus co-infection in Yellow-Chickens in Southern China

Wang

et al. 2021

Poultry Science

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First report on molecular characterization and phylogenetic analysis of Reticuloendotheliosis virus in Sudan

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Molecular Detection of Reticuloendotheliosis Virus 5′ Long Terminal Repeat Integration in the Genome of Avipoxvirus Field Strains from Different Avian Species in Egypt

Molecular Detection of Reticuloendotheliosis Virus 5′ Long Terminal Repeat Integration in the Genome of Avipoxvirus Field Strains from Different Avian Species in Egypt

Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil

Reemergence of reticuloendotheliosis virus and Marek's disease virus co-infection in Yellow-Chickens in Southern China

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