У статті удосконалено методику контролю видатків бюджетних установ, яка дозволить контролеру охопити всі аспекти обліку видатків, дасть змогу дослідити правильність, доцільність, своєчасність, законність відображення в обліку операцій з ними, а також вчасно виявити порушення та провести якісну перевірку. У роботі також запропоновано використовувати окремі відомості касових та фактичних видатків, що систематизують існуючу інформацію, дозволять мінімізувати вірогідність помилок та штрафних санкцій, попередять проблеми, що можуть бути пов’язані з перекручуванням інформації. Представлені пропозиції щодо удосконалення обліку, оподаткування та контролю видатків бюджетних установ у подальшому можуть бути використані казначейською службою при моніторингу доцільності витрачання бюджетних коштів, а також внутрішніми аудиторами, працівниками державної аудиторської служби, ревізорами вищих управлінь контролю, податківцями тощо.