In silico studies for assessing physicochemical, pharmacokinetic and cytotoxic properties of bioactive molecules identified by LC-MS in Aloe vera leaf extracts

Bendjedid, Samira; Benouchenne, Djamila

doi:10.1016/j.sajb.2023.03.052

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“…La tecnología de acoplamiento molecular es un método de investigación in silico (modela-dos o simulaciones obtenidos en biología computacional), utilizado en el descubrimiento y detección de compuestos con funciones farmacológicas. Estudios in silico indican que compuestos antraquinónicos del A. vera poseen propiedades de importancia en la salud como anticancerígena, antiinflamatoria, cardioprotectora, antimicrobiana, inmunosupresora, hepatoprotectora y neuroprotectora (Majumder y col., 2019;Pasala y col., 2022;Bendjedid y Benouchenne, 2023). Esta técnica se basa en el principio "llave y cerradura", y permite identificar los sitios activos entre el ligando y receptor, obteniendo la conformación adecuada, analizando la estructura de ligando y receptor mediante el uso de software especializado (Li y col., 2021a).…”

Section: Ciencias Agropecuariasunclassified

Aloe vera: capacidad antioxidante y uso potencial como agente terapéutico en el tratamiento del Alzheimer mediante evaluación in silico

Velázquez-López,

García-Rojas,

Tornero-Martínez

et al. 2024

CienciaUAT

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El gel de Aloe vera es considerado una fuente natural de múltiples beneficios, originados por la acción combinada de vitaminas, aminoácidos, compuestos fenólicos, enzimas, minerales, ácidos orgánicos, lípidos y carbohidratos, que se relacionan con la mejora de enfermedades neuro-degenerativas como Alzheimer. Los ensayos in vitro e in silico permiten confirmar e identificar posibles beneficios de esta planta y sus compuestos en enfermedades. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la actividad antioxidante del gel de A. vera y mediante análisis in silico, establecer el potencial terapéutico de sus compuestos bioactivos en la enfermedad de Alzheimer. Se obtuvieron hojas de A. vera, de las que se extrajo el gel, retirando el exocarpio, se liofilizó y almacenó hasta su uso. Se caracterizó la capacidad antioxidante, se cuantificaron los compuestos fenólicos y flavonoides y se analizó la relación que existe entre los parámetros mediante correlación de Pearson. Mediante análisis in silico se evaluó el potencial de interacción de 8 compuestos del gel con la proteína gamma secretasa. El gel de A. vera obtuvo alta capacidad antioxidante por ABTS, DPPH, radical OH y poder reductor, usando bajas concentraciones para inhibir el 50 % de los radicales, y correlaciones positivas con fenoles totales y flavonoides. En el estudio in silico el compuesto que presentó mejor unión con gamma secretasa fue aloe-emodina, con menor energía libre de unión y menor concentración de constante de inhibición, sugiriendo su potencial uso como coadyuvante en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer.

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Section: Ciencias Agropecuariasunclassified

Aloe vera: capacidad antioxidante y uso potencial como agente terapéutico en el tratamiento del Alzheimer mediante evaluación in silico

Velázquez-López,

García-Rojas,

Tornero-Martínez

et al. 2024

CienciaUAT

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“…SwissADME was applied to assess the druggability of cleomin [46]. SwissADME is a web application that offers reliable predictive models for the pharmacokinetics and drug-likeness of synthetic and natural compounds with pharmacological interest based on their structural features [47][48][49]. As input data, the SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) of the compound were used and then submitted to analysis.…”

Section: In Silico Pharmacokinetics Prediction Of Cleominmentioning

confidence: 99%

Cleomin Exerts Acute Antinociceptive Effects in Mice via GABAB and Muscarinic Receptors

Opretzka,

Viana,

de Lima

et al. 2023

Pharmaceuticals

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Cleomin, a 1,3-oxazolidine-2-thione, was recently isolated from Neocalyptrocalyx longifolium, a species traditionally used for treating painful conditions. Reports about the pharmacological activities of cleomin are lacking. Here, the antinociceptive effects of cleomin were investigated using mice models of pain, namely the formalin, the cold plate, and the tail flick tests. Motor integrity was assessed in the rota-rod test. Antagonism assays and in silico docking analyses were performed to investigate the putative mechanisms of action. Cleomin (12.5–25 mg/kg), at doses that did not induce motor impairment, induced dose-dependent antinociception in both early and late phases of the formalin test and reduced nociceptive behaviors in both the cold plate and tail flick tests. Pretreatments with phaclofen and atropine attenuated the antinociceptive effects of cleomin, implicating the involvement of GABAB and muscarinic receptors. In silico docking studies suggested satisfactory coupling between cleomin and GABAB and M2 receptors, hence corroborating their role in cleomin’s activity. Pretreatments with naloxone, yohimbine, bicuculline, and methysergide did not affect the antinociception of cleomin. In silico pharmacokinetics prediction showed a good drug ability profile of cleomin. In conclusion, cleomin promoted antinociception mediated by GABAB and muscarinic receptors. These findings support further investigation of the analgesic potential of cleomin.

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Uncovering potential CDK9 inhibitors from natural compound databases through docking-based virtual screening and MD simulations

Singh,

Kumar,

Jung

et al. 2024

J Mol Model

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In silico studies for assessing physicochemical, pharmacokinetic and cytotoxic properties of bioactive molecules identified by LC-MS in Aloe vera leaf extracts

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Aloe vera: capacidad antioxidante y uso potencial como agente terapéutico en el tratamiento del Alzheimer mediante evaluación in silico

Aloe vera: capacidad antioxidante y uso potencial como agente terapéutico en el tratamiento del Alzheimer mediante evaluación in silico

Cleomin Exerts Acute Antinociceptive Effects in Mice via GABAB and Muscarinic Receptors

Uncovering potential CDK9 inhibitors from natural compound databases through docking-based virtual screening and MD simulations

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