Os conteúdos da área de Ciências da Natureza e suas Tecnologias, que estão previstos na Base Nacional Comum Curricular, e que abordam genética, imunologia e evolução biológica, costumam ser apontados como de difícil aprendizado por parte dos estudantes do ensino médio. Os processos de ensino e de aprendizagem nas escolas de ensino médio têm sido predominantemente teóricos, com poucas atividades práticas. Assim, nos últimos anos, tem sido proposto o uso de estratégias didáticas que contemplem metodologias ativas. Portanto, esta pesquisa teve como objetivo investigar se as metodologias ativas têm sido empregadas por professores de ensino médio para o ensino de conteúdos da área de Ciências da Natureza e suas Tecnologias, bem como avaliar a percepção dos estudantes quanto à contribuição do uso de metodologias ativas para o seu aprendizado. Esta pesquisa, qualitativa, quantitativa e descritiva, foi realizada por meio de um questionário aplicado junto a estudantes de graduação do primeiro e do segundo semestre da Unochapecó. O questionário foi aplicado durante o segundo semestre de 2020 através do Google Forms. A maior parte dos participantes relataram que não tiveram aulas com o emprego de metodologias ativas durante o ensino médio e relataram não ter tido dificuldades de aprendizado dos conteúdos de genética, imunologia e evolução biológica. Finalizando, a maior parte dos participantes relataram que as metodologias ativas, quando aplicadas, não contribuíram para seu aprendizado ou que não lembram da sua contribuição. Os resultados obtidos através deste estudo apontam que é necessário investigar o motivo de a maior parte dos estudantes considerar que as metodologias ativas não contribuem para seu aprendizado, buscando assim, aprimorar estas estratégias didáticas e, consequentemente, o processo de ensino-aprendizado.