Salah satu faktor yang memengaruhi rendahnya keterampilan proses sains peserta didik adalah pemilihan media pembelajaran oleh pendidik. Salah satu cara untuk meningkatkan keterampilan proses sains peserta didik yaitu dengan menggunakan e-modul Cooperative Learning berbantuan Sigil software. Penelitian ini dilakukan guna mengetahui kelayakan e-modul Cooperative Learning berbantuan Sigil software untuk meningkatkan Keterampilan Proses Sains yang ditinjau dari validitas, kepraktisan, dan keefektifan. Penelitian ini menggunakan model pengembangan 4D yaitu Define, Design, Development dan Dissemination. Subjek penelitian ini adalah 10 peserta didik pada uji coba terbatas dan 36 peserta didik pada uji coba luas. Instrumen yang digunakan dalam penelitian ini adalah lembar validasi, angket respon peserta didik, observasi keterlaksanaan pembelajaran, dan tes keterampilan proses sains. Analisis data dalam penelitian ini meliputi uji validitas, uji reliabilitas, dan uji N-gain. Berdasarkan penelitian diperoleh: (1) validitas media mendapatkan nilai rerata 3,4 dengan kategori “baik”. Sehingga dapat dikatakan valid. (2) kepraktisan media ditinjau dari hasil observasi keterlaksanaan pembelajaran dengan percentage agreement sebesar 99% yang termasuk dalam kategori “realiabel” dan angket respon peserta didik (uji coba luas) dengan persentase sebesar 83,43% dalam kategori “baik, dan (3) keefektifan media dapat dilihat dari peningkatan hasil belajar keterampilan proses sains peserta didik yang memperoleh nilai Normalized gain sebesar 0,80 yang termasuk dalam kategori “tinggi”. Dengan demikian maka e-modul Cooperative Learning berbantuan Sigil Software dinyatakan valid, praktis, dan efektif sehingga layak digunakan untuk meningkatkan keterampilan proses sains peserta didik.