Les microsatellites des génomes eucaryotes

Abstract

Caractéristiques des séquences microsatellitesLes microsatellites 1 appelés également simple sequences ou short tandem repeats, sont des séquences simples et courtes, composées d'un motif k répété n fois [1]. La longueur du motif k varie de 1 à 6 bases répétées en tandem 2 et les différentes catégories sont désignées en fonction du nombre de bases contiguës constituant k. Elle faisait initialement référence à la propriété qu'ont certaines séquences du génome humain à sédimenter telles des bandes satellites séparées de la majeure partie de l'ADN génomique lors de centrifugations en gradient de densité ; cette propriété s'explique par leur composition nucléotidique particulière. Les premières séquences satellites identifiées se situaient au niveau des télomères. Par la suite, des séquences répétées en tandem plus courtes, ont été identifiées et nommées mini-et microsatellites. 2 Ce seuil n'étant pas admis par l'ensemble de la communauté scientifique, certaines ambiguïtés apparaissent dans la littérature incluant sous le terme microsatellite des séquences ayant un motif k > 6 bases.> L'exceptionnel pouvoir discriminant des marqueurs microsatellites leur a permis de conqué-rir de nombreux domaines comme la médecine légale, la génétique des populations, ou encore la biologie de la conservation. Mais bien que très populaires, leur dynamique évolutive ne reste que vaguement comprise. Nos connaissances passées, combinées aux résultats récemment publiés, nous en disent plus long sur leur dynamique mutationnelle, et comment celle-ci peut se concevoir en terme de « cycle de vie ». Les principaux facteurs impliqués dans ce cycle, et dans le passage d'un stade à un autre, sont discutés. Cette vue globale met en évidence la difficulté d'envisager un modèle unique d'évolution de ces séquences, présumant d'une dynamique très complexe et loin d'être neutre. <

Gene Conversion Violates the Stepwise Mutation Model for Microsatellites inY‐Chromosomal Palindromic Repeats

“…Both repeat unit length and repeat number directly influence their polymorphism and mutation rates (reviewed by [Schlotterer, 2000 ]). This dynamic nature has motivated the comparison [Buschiazzo and Gemmell, 2006 ; Balaresque, 2007 ] of microsatellite evolution with a life cycle (Fig. 6 ).…”