Limits of a rapid identification of common Mediterranean sandflies using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism

Abstract

A total of 131 phlebotomine Algerian sandflies have been processed in the present study. They belong to the species Phlebotomus bergeroti, Phlebotomus alexandri, Phlebotomus sergenti, Phlebotomus chabaudi, Phlebotomus riouxi, Phlebotomus perniciosus, Phlebotomus longicuspis, Phlebotomus perfiliewi, Phlebotomus ariasi, Phlebotomus chadlii, Sergentomyia fallax, Sergentomyia minuta, Sergentomyia antennata, Sergentomyia schwetzi, Sergentomyia clydei, Sergentomyia christophersi and Grassomyia dreyfussi. They have been characterised by sequencing of a part of the cytochrome b (cyt b), t RNA serine and NADH1 on the one hand and of the cytochrome C oxidase I of the mitochondrial DNA (mtDNA) on the other hand. Our study highlights two sympatric populations within P. sergenti in the area of its type-locality and new haplotypes of P. perniciosus and P. longicuspis without recording the specimens called lcx previously found in North Africa. We tried to use a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism method based on a combined double digestion of each marker. These method is not interesting to identify sandflies all over the Mediterranean Basin.

Molecular systematics applied to Phlebotomine sandflies: Review and perspectives

“…A total of 83 intraspecific studies has been recorded in the literature (Esseghir et al, 1997;Marcondes et al, 1997;Dias et al, 1998;Aransay et al, 2000Aransay et al, , 2003Di Muccio et al, 2000;Esseghir and Ready, 2000;Mukhopadhyay et al, 2000;Yin et al, 2000;Marquez et al, 2001;Soto et al, 2001;Arrivillaga et al, 2002Arrivillaga et al, , 2003Bauzer et al, 2002a,b;Depaquit et al, , 2004aDepaquit et al, , 2005bDepaquit et al, , 2008bDepaquit et al, , 2013Depaquit et al, , 2014Hodgkinson et al, 2002Hodgkinson et al, , 2003Testa et al, 2002;Bottecchia et al, 2004;Margonari et al, 2004;Pesson et al, 2004;Yahia et al, 2004;Elnaiem et al, 2005;Meneses et al, 2005;Perrotey et al, 2005;Dvorak et al, 2006Dvorak et al, , 2011Mazzoni et al, 2006Mazzoni et al, , 2008de Souza Rocha et al, 2007;Hamarsheh et al, 2007;Moin-Vaziri et al, 2007a,b;Baron et al, 2008;Bounamous et al, 2008Bounamous et al, , 2014Lins et al, 2008…”

“…A total of 55 papers comparing different species or subspecies within a genus has been recorded (Booth et al, 1991(Booth et al, , 1994Adamson et al, 1993;Maingon et al, 1993;Esseghir et al, 1997;Marcondes et al, 1997;Aransay et al, 2000;Depaquit et al, 2000Depaquit et al, , 2005bDepaquit et al, , 2008aDepaquit et al, ,b, 2014Di Muccio et al, 2000;Esseghir and Ready, 2000;Mukhopadhyay et al, 2000;Soto et al, 2001;Lins et al, 2002;Mazzoni et al, 2002Mazzoni et al, , 2006Mazzoni et al, , 2008Testa et al, 2002;Torgerson et al, 2003;Beati et al, 2004;Pesson et al, 2004;Moin-Vaziri et al, 2007a;Bounamous et al, 2008Bounamous et al, , 2014Perez-Doria et al, 2008a;Absavaran et al, 2009;Kuwahara et al, 2009;Vivero et al, 2009;Azpurua et al, 2010;Franco et al, 2010;Khalid et al, 2010Khalid et al, , 2012Parvizi et al, 2010a,b;Belen et al, 2011;Kruger et al, 2011;Latrofa et al, 2011a,b;Kumar et al, 2012;Randrianambinintsoa et al, 2012Jafari et al, 2013;…”

“…Lastly, a total of 22 publications comparing taxa belonging to different genera has been recorded (Esseghir et al, 1997;Depaquit et al, 1998Depaquit et al, , 1999Aransay et al, 2000;Esseghir and Ready, 2000;Lins et al, 2002Mazzoni et al, 2002;Torgerson et al, 2003;Vivero et al, 2007Vivero et al, , 2009Terayama et al, 2008;Kuwahara et al, 2009;Azpurua et al, 2010;Kruger et al, 2011;Latrofa et al, 2011b;Kumar et al, 2012;Jafari et al, 2013;Minter et al, 2013;Yamamoto et al, 2013;Bounamous et al, 2014;Contreras Gutierrez et al, 2014).…”

“…Some studies used Random Amplified polymorphic DNA (RAPD) Maingon et al, 1993;Dias et al, 1998;Mukhopadhyay et al, 2000;Margonari et al, 2004;Meneses et al, 2005;Dvorak et al, 2006Dvorak et al, , 2011de Souza Rocha et al, 2007;Seblova et al, 2013) Bounamous et al, 2014) or the Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) .…”

“…Cytochrome b (cyt b), complete or not, with or without partial flanking NADH1 and tRNA-ser is the most commonly used (Table 1 and Fig. 2) (Esseghir et al, 1997;Marcondes et al, 1997;Esseghir and Ready, 2000;Hodgkinson et al, 2002Hodgkinson et al, , 2003Testa et al, 2002;Aransay et al, 2003;Torgerson et al, 2003;Pesson et al, 2004;Yahia et al, 2004;Depaquit et al, 2005aDepaquit et al, , 2007Depaquit et al, , 2008aDepaquit et al, , 2013Depaquit et al, , 2014Perrotey et al, 2005;Hamarsheh et al, 2007;Moin-Vaziri et al, 2007a,b;Muller et al, 2007;Vivero et al, 2007Vivero et al, , 2009; Baron et al, 2008;Bounamous et al, 2008Bounamous et al, , 2014Perez-Doria et al, 2008a;Absavaran et al, 2009;Bejarano et al, 2009;Franco et al, 2010;Mahamdallie et al, 2010;Parvizi et al, 2010a,b;Belen et al, 2011;Dvorak et al, 2011;Kruger et al, 2011;Latrofa et al, 2011a,b;Cohnstaedt et al, 2012;Léger et al, 2012Léger et al, , 2014Randrianambinintsoa et al, 2012…”