<b>Pesquisa de terminologias e ontologias atuais em biologia e medicina</b>

Abstract

Panorama geralA crescente disponibilidade digital de enormes quantidades de fontes de dados e conhecimentos biomédicos sobrecarregou os pesquisadores e médicos com a

Aspectos ontológicos e epistemológicos em terminologias clínicas: em busca de interoperabilidade semântica no ambiente clínico

“…A proliferação de padrões terminológicos não é necessariamente profícua, resultando em sobreposições sintática e semântica, comprometendo a interoperabilidade entre sistemas e possibilidades de automação (FREITAS, SCHULZ e MORAES, 2009).…”

“…Cabe destacar duas situações específicas em relação às terminologias clínicas. A primeira diz respeito ao fato de que muitas vezes os termos são definidos por expressões da linguagem natural associadas por relações informais (FREITAS, SCHULZ e MORAES, 2009). A segunda situação diz respeito aos diferentes tipos de termos utilizados nas terminologias para representação: alguns de fato dizem respeito a universais 1 ; outros, porém são "declarações disfarçadas de classes reais 2 " (BODENREIDER, SMITH e BURGUN, 2004, p.2).…”

Suporte ao desenvolvimento e à integração de ontologias no domínio biomédico

“…O sucesso obtido no domínio biomédico levouà proliferação de ontologias para esse domínio. Porém, essa proliferação tornou-se um empecilho ao uso efetivo dessas ontologias, dada a ausência de esforços de padronização e alinhamento entre as ontologias desenvolvidas [17,18,19].…”

“…Em aplicações para o suporteà gestão de conhecimento, ontologias podem ser usadas como fontes para vocabulários padronizados [17,85]. Neste sentido, os termos da ontolgia são utilizados na anotação, codificação, indexação e busca de recursos e dados biológicos.…”

“…Porém, a falta de um esforço de padronização e alinhamento entre as ontologias desenvolvidas representa um obstáculoà integração e, em consequência, a um uso mais efetivo destas ontologias. Os principais problemas são a criação de ontologias com sobreposição de conceitos, com formatos de representação diversos e não interoperáveis [17,18,19]. Em resposta a tal situação, a Open Biological and Biomedical Ontologies Foundry (OBO Foundry) foi criada como um experimento colaborativo para o alinhamento e a coordenação dos esforços no desenvolvimento e gestão de ontologias para os domínios biológicos e biomédicos [18,20].…”