Modélisation cellulaire pour l'émergence de structures multiprotéiques auto-organisées

Abstract

National audienceSystems biology and cell simulation started together and maintain a controvertible relationship within the scope of global approaches and emergence-driven approaches. Here, we present a multi-agent based model for cell simulation. We describe the whole model creation process, from its scientific project perspective to implementation considerations. The agents interactions model will be particularly detailed. Finally, preliminary results showing self-organised structures will be presented to demonstrate the interest of this approach.La biologie des systèmes et la simulation cellulaire sont nées conjointement et entretiennent des relations ambiguës entre approches globalisantes et approches émergentistes. Nous présentons ici une démarche émergentiste de la modélisation cellulaire, basée sur une simulation multiagent. Nous décrivons l'ensemble du processus de création du modèle, depuis le projet scientifique jusqu'aux méthodes d'implémentation, en insistant particulièrement sur le modèle d'interactions entre agents qui est la base de notre simulation. Enfin, des résultats préliminaires montrant l'émergence de structures organisées sont présentés pour illustrer l'intérêt de l'approche proposée