Molecular Analysis of Nsp4 Coding Gene of Porcine Rotavirus in Brazil

Abstract

RESUMOA proteína não estrutural 4 (NSP4) desempenha diferentes funções na replicação e na morfogênese dos rotavírus, apresentando, ainda, uma atividade de enterotoxina, causando diarreia do tipo secretória. Um total de 11 sequências parciais de nucleotídeos do gene codificador da NSP4 de rotavírus suínos de criações brasileiras foram definidas como pertencentes ao grupo A. Comparando-se as sequências virais da área do peptídeo toxigênico, que compreende a porção entre os aminoácidos de 114 a 135, constatou-se uma única mutação pontual no aminoácido 135, sendo que duas amostras apresentaram alanina, e as demais, valina. A análise filogenética do gene demonstrou que todas as amostras pertencem ao genotipo E1, e que a identidade nucleotídica das amostras brasileiras variou de 92,4% a 100%, enquanto que a identidade de aminoácidos, de 95,8% a 100%. Apenas um resíduo (aa 138) sofreu seleção positiva enquanto que pelo menos outros 119 apresentam seleção negativa. Assim, esses dados mostram a ocorrência de um genotipo comum da NSP4 já descrito anteriormente em suínos, com uma baixa diversidade entre as amostras encontradas. PALAVRAS-CHAVE:Genotipos. Proteína não-estrutural. Reoviridae. SUMMARYThe non-structural protein 4 (NSP4) has different roles in rotaviral replication, morphogenesis, and enterotoxin-like activity causing secretory diarrhea. A total of 11 partial nucleotide sequences of NSP4 coding gene were defined from group A rotavirus circulating in Brazilian swine herds. On comparing the viral sequences of diarrheagenic peptide area (amino acid 114-135), there was a single point mutation at amino acid 135 presented by two strains with amino acid alanine, and valine in the others. The NSP4 gene phylogeny showed that all strains clustered into E1 genotype, and the nucleotide identity between Brazilian strains ranged from 92.4% and 100%, while the putative amino acid identity, between 95.8% and 100%. Only one site (138aa) was positively selected and at least 119 were negatively selected. As a conclusion, these data demonstrate the occurrence of a common NSP4 genotype described elsewhere in pigs and low diversity between the samples from the surveyed areas.

<b>Análise multigênica de rotavírus do grupo A em aves de criações comerciais brasileiras</b>

“…No entanto, a influência da pressão de seleção vem sendo estudada entre diferentes amostras de RVs em mamíferos, porém limitadas às proteínas VP7 e NSP4 (SONG; HAO, 2009;MALIK et al, 2014;CUNHA et al, 2015), no entanto pouco se sabe acerca das demais proteínas dos RVs (DONKER et al, 2011).…”