En este artículo se propone un metamodelo para el almacenamiento de datos de eventos de salud y de partículas PM2.5, en la ciudad de Medellín-Colombia. Se aborda el problema de la consolidación de datos a partir de fuentes heterogéneas. La solución que se presenta es una aproximación basada en modelos, donde los aspectos comunes se identifican para la construcción de una bodega de datos. Como resultado principal, se definió una capa de abstracción sobre los modelos conceptuales de material particulado y eventos de salud, y con ello se obtuvo un prototipo de bodega. A partir del trabajo realizado se puede concluir que el uso de un enfoque basado en modelos fortalece la toma de decisiones en políticas de salud pública y estrategias de gestión de calidad en salud.