Millán: caracterización fenotípica y molecular de las cepas estudiadas, análisis bioinformático María Araque: diseño del estudio y discusión crítica Todas las autoras participaron en la escritura del manuscrito. Introducción. En Venezuela existen pocos reportes que describan las bases genéticas del potencial patogénico y filogenético de las cepas de Escherichia coli provenientes de hospitales. Objetivo. Determinar la diversidad genética de cepas extraintestinales de E. coli productoras de las betalactamasas TEM, SHV y CTX-M asociadas a la atención de salud. Materiales y métodos. Se estudió una colección de 12 cepas extraintestinales de E. coli con sensibilidad disminuida a las cefalosporinas de amplio espectro. La sensibilidad antimicrobiana se determinó por concentración inhibitoria mínima. La detección de los grupos filogenéticos, de los factores de virulencia y de los genes que codifican la resistencia antimicrobiana se hizo mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa y la relación clonal se estableció mediante reacción en cadena de la polimerasa de elementos palindrómicos extragénicos repetitivos (Repetitive Element Palindromic-PCR, rep-PCR).
Diversidad genética de cepas extraintestinales deResultados. Todas las cepas analizadas presentaron resistencia a las cefalosporinas, y resistencia conjunta a quinolonas y aminoglucósidos. La distribución filogenética evidenció que los grupos A y B1 fueron los más frecuentes, seguidos por D y B2; en este último, se detectaron todos los factores de virulencia evaluados, y el gen más frecuente fue el fimH. En todas las cepas analizadas, se encontró bla CTX-M , con predominio de las bla CTX-M-8 , y en dos de estas cepas se evidenció la presencia simultánea de bla CTX-M-9 , variantes bla CTX-M-65 y bla CTX-M-147 . Conclusión. Las cepas estudiadas demostraron diversidad genética y albergaron diferentes genes de virulencia y betalactamasas de espectro extendido (BLEE) sin predominio de ningún filogrupo en particular. Este estudio constituye el primer reporte de la variante bla CTX-M-65 en Venezuela y de la variante bla CTX-M-147 en el mundo, en cepas no relacionadas genéticamente aisladas de hospitales, situación que merece atención y la racionalización del uso de los antimicrobianos.Palabras clave: Escherichia coli; infección hospitalaria; betalactamasas; filogenia; reacción en cadena de la polimerasa.doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v37i3.3324
Genetic diversity of extraintestinal Escherichia coli strains producers of beta-lactamases TEM, SHV and CTX-M associated with healthcareIntroduction: There are few reports from Venezuela describing the genetic basis that sustains the pathogenic potential and phylogenetics of Escherichia coli extraintestinal strains isolated in health care units. Objective: To establish the genetic diversity of extraintestinal E. coli strains producers of betalactamases TEM, SHV and CTX-M associated with healthcare.
Materials and methods:We studied a collection of 12 strains of extraintestinal E. coli with diminished sensitivity ...