Parameter estimation in dynamic metabolic models applying a surrogate approximation

Oliveira, Rafael D. de; Procópio, Dielle Pierotti; Basso, Thiago Olitta; Roux, G.

doi:10.1016/b978-0-323-95879-0.50036-9

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“…The results show that the control strategy provides a higher ethanol titer in com- Remark. The results presented here are based on the works Oliveira et al (2021a) and Oliveira et al (2022). Originally the surrogate FBA methodology was developed for application of dFBA models in Economic MPC of bioreactors.…”

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Métodos numéricos para modelos de redes metabólicas.

Oliveira¹

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Começo agradecendo ao meu orientador Prof. Galo Le Roux por todo o apoio e incentivo durante todos esses anos, e por entender que o trajeto de um doutorando vai muito além da pesquisa que ele realiza. Agradeço também ao Prof. José Gregório por todas as ótimas sugestões e discussões durante essa jornada. I would also like to thank Prof.Mahadevan and Prof. Johannes, for having me in their research groups and for contributing to my education as a researcher.Agradeço aos meus caros amigos de casa: Leonardo, Gustavo, Rafael (Vaca) e Gabriel (Vila) por todos os debates sobre política, futebol, filosofia e economia. Aos meus caros amigos que fiz nesses seis anos em São Paulo: Priscila (Jesus e Paz), Irena, Zé Otávio, Zé Eduardo, María, Javier, Dielle e Dondon pela amizade e pelo café de todo dia.À Carol pelo apoio em diversos aspectos desse trabalho e pela amizade. Thank to all my colleagues and friends from Toronto and Trondheim that made me feel at home. Eu gostaria de agradecer à agência de fomento Coordenação de Aperfeiçoamento de pessoal de Nível Superior (CAPES) pelo apoio financeiro nacional e para a realização do doutorado sanduíche.Agradeço à Tamires pela parceria e por me fazer conseguir superar todas as adversidades durante a elaboração dessa tese. Por fim, gostaria de agradecer à minha família por tornar possível a realização dessa tese e por acreditar em mim sempre.

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“…This chapter focus is the formulation of EMPC with surrogate FBA as described in Oliveira et al (2021a) (Study case 1). Also, the parameter estimation application was included as described in Oliveira et al (2022) as Study case 2.…”

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