Polynomials to model the growth of young bulls in performance tests

Scalez, Daiane Cristina Becker; Fragomeni, B. O.; Passafaro, Tiago Luciano; Pereira, Idalmo Garcia; Toral, Fábio Luiz Buranelo

doi:10.1017/s1751731113002334

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“…For MA group, age ranged from 166 to 707 days. Information on the average weight and the number of observations for each age was reported in Scalez et al (2014).…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

“…The growth of Bos indicus (Riley et al, 2007;Boligon et al, 2012;Lopes et al, 2012;Scalez et al, 2014;Bertipaglia et al, 2015), Bos taurus (Meyer, 2005a,b;Mota et al, 2013b), and crossbred beef cattle (Sánchez et al, 2008;Baldi et al, 2010;Mota et al, 2013a;Scalez et al, 2014) has been modeled by random regression models. Legendre polynomials are the typical choice for most researchers for fitting mean growth trajectories and also additive and permanent environmental effects.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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Random regression models with B-splines to estimate genetic parameters for body weight of young bulls in performance tests

et al. 2018

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The objective of this study was to estimate genetic parameters for body weight of beef cattle in performance tests. Different random regression models with quadratic B-splines and heterogeneous residual variance were fitted to estimate covariance functions for body weights of Nellore and crossbred Charolais × Nellore bulls. The criteria −2 residual log-likelihood (−2RLL), Akaike Information Criterion (AIC), and consistent AIC (CAIC) were used to choose the most appropriate model. For Nellore bulls, residual variance was modeled with six classes of age, and direct additive genetic and permanent environment effects were modeled with quadratic B-splines with two and one intervals, respectively. For crossbred bulls, quadratic B-splines with one interval fitted direct additive genetic and permanent environment effects and nine classes of age were needed to fit residual variance. Pooling classes of age with up to 40% in difference of residual variances does not compromise the fit of the model. Heritability for body weight in performance tests are moderate (>0.25, for crossbred bulls) to high (>0.5, for Nellore bulls) and genetic correlation between weights over the test are also high (>0.65). Then, selection of young bulls in performance test is an efficient tool to increase body weight in beef cattle.

show abstract

“…For MA group, age ranged from 166 to 707 days. Information on the average weight and the number of observations for each age was reported in Scalez et al (2014).…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Random regression models with B-splines to estimate genetic parameters for body weight of young bulls in performance tests

et al. 2018

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“…Toral et al (2009) alertaram para a possibilidade de agrupar classes de idades adjacentes e com variâncias residuais semelhantes. Este procedimento foi aplicado com sucesso por Scalez et al (2014), para a análise do peso de tourinhos Nelore e mestiços Charolês x Nelore.…”

Section: Methodsunclassified

“…Polinômios de Legendre até a ordem cúbica são utilizados para a modelagem das trajetórias médias de crescimento. Diferenças de ordens de ajustes das trajetórias médias influenciam as funções de covariância (Scalez et al, 2014), mas pouca atenção tem sido dada ao ajuste deste efeito.…”

Section: Introductionunclassified

Parâmetros genéticos do peso desde o nascimento até 730 dias de idade na raça Indubrasil

Toral

Pereira

Bergmann

et al. 2014

Pesq. agropec. bras.

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Resumo -O objetivo deste trabalho foi determinar parâmetros genéticos do peso desde o nascimento até 730 dias de idade na raça Indubrasil. Registros de peso (82.481) de 20.890 animais do nascimento aos 730 dias de idade foram utilizados. Os parâmetros genéticos foram determinados por meio de regressão aleatória. Amostras da distribuição a posteriori dos parâmetros de interesse foram obtidas com o amostrador de Gibbs. Polinômios de Legendre ou segmentados foram utilizados para modelar a trajetória média de crescimento. Os efeitos genético aditivo direto e de ambiente permanente direto foram modelados por polinômios de Legendre. Um polinômio segmentado linear-linear, com nó aos 251 dias de idade, ajustou a trajetória média. Polinômios de Legendre quadráticos e quínticos ajustaram, respectivamente, os efeitos genético aditivo e de ambiente permanente. Três classes de idade foram suficientes para modelar a heterocedasticidade residual. Na maior parte do intervalo considerado, as médias a posteriori da herdabilidade foram crescentes, com valores entre 0,10 e 0,45; a proporção da variância de ambiente permanente em relação à variância fenotípica foi constante, em torno de 0,48; e as correlações genéticas dos pesos em diferentes idades foram altas, acima de 0,60. Há variabilidade genética quanto ao peso na raça Indubrasil, e a seleção pode aumentar a média desta característica.Termos para indexação: Bos taurus, correlação, herdabilidade, polinômios de Legendre, regressão aleatória, seleção. Genetic parameters for weight from birth to 730 days of age in Indubrasil breedAbstract -The objective of this work was to determine the genetic parameters for weight from birth to 730 days of age in Indubrasil breed. Weight data set (82,481) of 20,890 animals from birth to 730 days of age were used. The genetic parameters were determined by random regression. A posteriori distributions of the parameters of interest were obtained by the Gibbs sampler. Legendre or segmented polynomials were used to model the average growth trajectory. The direct additive genetic effect and direct permanent environmental effect were fit by Legendre polynomials. A linear-linear segmented polynomial, with a knot at 251 days of age, fitted the average growth trajectory. Quadratic and quintic Legendre polynomials fitted the direct additive genetic and permanent environmental effects, respectively. Three age classes were enough to model the residual heteroscedasticity. In the most part of the considered interval, the a posteriori means of heritability increased, with values between 0.10 and 0.45; the proportion of permanent environmental variance was constant in relation to the phenotypic variance and close to 0.48; and the genetic correlations of weight at different ages were high, over 0.60. There is genetic variability for weight in Indubrasil breed, and the selection can improve this trait's mean.

show abstract

“…A separação dos efeitos genético materno e de ambiente materno permanente é complexa (Meyer, 1992) Os efeitos de ambiente temporário, em bovinos de corte, não são constantes ao longo do tempo (Dias et al, 2006;Scalez et al, 2014;Toral et al, 2014).…”

Section: Methodsunclassified

Análise genética do peso em um rebanho de bovinos Nelore

Passafaro

Fragomeni

Gonçalves³

et al. 2016

Pesq. agropec. bras.

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Resumo -O objetivo deste trabalho foi determinar os parâmetros genéticos para o peso de bovinos Nelore, do nascimento até 1.000 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória. Utilizaram-se 115.096 registros de peso de 19.417 animais. Os parâmetros genéticos foram obtidos por modelos de regressão aleatória via inferência bayesiana. A trajetória média de crescimento foi ajustada com um polinômio de Legendre quártico. O efeito genético aditivo direto foi ajustado com um polinômio quadrático de Legendre. Os efeitos de ambiente permanente direto e materno foram ajustados com polinômios de Legendre quíntico e quadrático, respectivamente. A variância residual foi modelada com três classes de idades. Os valores genéticos dos pesos, do nascimento até 1.000 dias de idade, foram utilizados para a análise da tendência genética, por meio de superfícies de resposta. As herdabilidades variaram entre 0,16 e 0,47. Os efeitos de ambiente permanente direto e materno foram responsáveis por 5 a 77% e 0,2 a 11% da variância fenotípica, respectivamente. As correlações genéticas dos pesos em diferentes idades foram altas e superiores a 0,40. Os valores genéticos foram crescentes ao longo dos anos, e a tendência genética foi máxima para peso aos 500 dias.Termos para indexação: Bos indicus, inferência bayesiana, parâmetro genético, seleção, superfície de resposta. Genetic analysis of body weight in a Nellore cattle herdAbstract -The objective of this work was to determine the genetic parameters for body weight of Nellore cattle, from birth to 1,000 days of age, by random regression models. Data from 115,096 body weight records of 19,417 animals were used. The genetic parameters were obtained by random regression models and Bayesian inference. The average growth trajectory was fitted by a fourth-order Legendre polynomial. The additive direct effect was fitted by a quadratic Legendre polynomial. Direct and maternal permanent environmental effects were fitted by the fifth-and second-order Legendre polynomials, respectively. Residual variance was modeled by three classes of age. The breeding values of weights obtained from birth to 1,000 days of age were used for the analysis of genetic trend by response surfaces. Heritability ranged from 0.16 to 0.47. The direct and maternal permanent environmental effects explained 5 to 77% and 0.2 to 11% of the phenotypic variance, respectively. The genetic correlations of body weights at different ages were high and above 0.40. Breeding values increased throughout the years, and genetic trend was maximum for body weight at 500 days.

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Polynomials to model the growth of young bulls in performance tests

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Random regression models with B-splines to estimate genetic parameters for body weight of young bulls in performance tests

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Análise genética do peso em um rebanho de bovinos Nelore

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