Objetivo: Mapear fatores protetivos relacionados à microbiota intestinal de pacientes adultos com câncer colorretal em tratamento quimioterápico endovenoso. Casuística e Método: Protocolo de revisão de escopo realizado de janeiro a junho de 2023, conforme metodologia do Joanna Briggs Institute Evidence Synthesis, em conformidade com o checklist PRISMA-ScR, seguindo as etapas propostas pelo Instituto Joanna Briggs: identificar a questão de pesquisa, os estudos relevantes, seleção dos estudos e mapeamento dos dados. O mnemônico PCC (população, conceito e contexto) determinou a questão de pesquisa: Quais os fatores protetivos para a microbiota intestinal de pacientes adultos com câncer colorretal em tratamento quimioterápico endovenoso? O acrônimo PCC foi utilizado para a coleta de dados, a qual foi realizada de janeiro a junho de 2023. Foram incluídas as seguintes fontes de informação: Lilacs/Biblioteca Virtual em Saúde, Medline/PubMed, Embase e Scopus, Web of Science, COCHRANE, CINAHL e Academic Search Premier, Food Science Source e Food Science and Technology Abstracts, Google Scholar e o Catálogo de Teses & Dissertações da CAPES, publicados em todos os idiomas e sem limite temporal. A seleção foi realizada por dois revisores independentes e as divergências apreciadas por um terceiro revisor. A extração dos dados foi realizada por meio de instrumento de coleta elaborado pelos autores, após teste piloto. Os dados serão apresentados de acordo com os objetivos e questões de pesquisa. Registro da revisão no Open Science Framework-OSF.IO/Y2U6V.