Profiling of differentially expressed proteins in mature kernels of Korean waxy corn cultivars using proteomic analysis

Advances in the Biology of Seed and Vegetative Storage Proteins Based on Two-Dimensional Electrophoresis Coupled to Mass Spectrometry

“…Prolamins are the major proteins in endosperm and they are more variable than globulins. In maize grain, zeins are the most abundant storage proteins and are mainly accumulated in the endosperm between 12 and 40 days after pollination [ 96 ]. They are grouped into α (19 and 22 kDa), β (16 kDa), γ (16, 27 and 50 kDa) and δ (10 kDa) zeins [ 63 ].…”

“…For instance, patatin isoforms are encoded by a multigene family constituted by ~10–18 genes per haploid genome [ 28 ] and exhibit a sequence homology of at least 90% [ 58 , 117 ]. In addition, many other factors can lead to erroneous conclusions in MS-driven PTM analysis such as the co-elution of peptides, the loss of phosphoryl group during ionization process and phosphate transfer to acceptor residues, a lack of reproducibility and a low number of commonly used biological replicates [ 96 , 112 , 118 ]. It is noteworthy that some of these methodological constraints apply to powerful MS-based methods used for quantitative proteomics such as stable isotope labeling with amino acids in cell culture (SILAC) and isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ).…”

Estudo proteômico de variedades de milho (<i>Zea mays</i> L.) obtidas por melhoramento clássico e por recombinação genética

“…Destas oito categorias principais, as mais evidentes nas três comparações realizadas foram armazenamento, defesa/estresse celular, metabolismo e energia. Em concordância com estudos prévios, observou-se uma maior predominância de proteínas significativamente expressas nestas funções biológicas quando analisadas sementes de milho (KOMATSU et al, 2012;WANG et al, 2014;KIM et al, 2015).…”

“…A predominância dos grupos funcionais metabolismo e energia, com inúmeras vias representadas, também foi relatada em estudos anteriores com variedades QPMs (KOZIOL et al, 2012;GUO et al, 2012;JIA et al, 2013;KIM et al, 2015;LI et al, 2016).…”

“…É essencial para a manutenção dos níveis de ATP celular e metabolismo de carboidratos nas células. Previamente, a GAPDH foi relacionada com a remoção de espécies reativas ao oxigênio (ROS) e tolerância ao estresse (HANCOCK et al 2005;KIM et al, 2015). Provavelmente, o baixo acúmulo desta enzima na variedade QP2, possa estar relacionado a sua atuação no metabolismo de carboidrato e síntese de amido.…”