Esta investigación se desarrolla en el ámbito de la modernización del Sistema Portuario de San Juan de Marcona, cuyo enfoque de sostenibilidad basado en el crecimiento de las actividades portuarias y la protección del ambiente marino, se encuentra vinculado a las operaciones que desarrollan las empresas mineras Shougang y Marcobre, a través de la gestión y manejo de los residuos sólidos y de mezclas oleosas que recepcionan de los buques en sus terminales. El objetivo fue analizar el ciclo de los residuos desde su fuente de generación hasta su disposición, a fin de conocer el estado de las condiciones ambientales que presentan las aguas costeras y el impacto en los ecosistemas acuáticos. La metodología presentó una investigación explicativa, identificándose el número de instalaciones de recepción acuática y terrestre existentes en la jurisdicción, cuyo resultado puso de manifiesto la escasa infraestructura y capacidad limitada para el almacenamiento temporal de los residuos, concluyéndose que los riesgos de contaminación marina y de la biota acuática, afectan significativamente a la vida submarina, la pesca, el turismo y las áreas protegidas.