El objetivo fue identificar los microorganismos en las superficies de unidades críticas en un hospital de segundo nivel relacionados con las infecciones asociadas a la atención en salud, no existe un consenso en la metodología ni frecuencia para el monitoreo microbiológico, pero es recomendado en brotes y como método de control de calidad. Se muestrearon 60 superficies en 12 unidades críticas, las muestras fueron recolectadas durante cinco días a las 7:00 am, antes de que se realicen los procesos de limpieza y desinfección. Los microorganismos aislados presentaron 12 variedades, con una mayor incidencia de Bacillus cereus 1.050 UFC/CM2, Staphylococcus. 913 UFC/CM2, Micrococcus. 504 UFC/CM2, Klebsiella. 214 UFC/CM2. En la central de esterilización, neonatología, centro obstétrico, nutrición, hemodiálisis y emergencia; de acuerdo con los criterios de valoración para contaminación de superficies se calificó a estas áreas como intolerables de acuerdo al número UFC/CM2 propuesto según Rosero, aislándose patógenos como Staphylococcus sp, Bacillus cereus, Escherichia Coli, Micrococcus sp, Klebsiella sp. Con una mayor incidencia de Gérmenes Gram+ 78,3% seguido de Gram- 18,3%, Hongos y levaduras 13,3%. Microbiota de bajo riesgo Staphylococcus sp. 28,3%, Bacillus cereus 28, 3%, Micrococcussp 20%.