Em meio à uma severa crise hídrica que acomete a Região Metropolitana de São Paulo, um importante sistema de abastecimento de água teve suas operações interrompidas. Este ensaio apresenta um estudo de caso do município de Cotia, que apresenta dois mananciais em situações antagônicas. Enquanto o sistema Baixo Cotia foi interditado em 2018 pela falta de condições sanitárias, o sistema Alto Cotia ainda apresenta bons índices de qualidade de água. Assim, objetivou-se compreender como a diferença da ocupação do solo e da preservação florestal influenciaram na qualidade de água dos dois mananciais. Utilizando dados históricos de ocupação, urbanização e monitoramento da qualidade da água, são apresentados os principais fatores que levaram a interdição do Baixo Cotia.