1 Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук, Москва, Россия 2 Российский университет дружбы народов, Москва, Россия Тополь широко используется в озеленении Москвы благо-даря способности эффективно очищать воздух от вредных примесей и выделять большое количество кислорода. Роду Тополь (Populus) свойствен высокий уровень внутривидо-вого полиморфизма, а также наличие естественных меж-видовых гибридов. Целью на стоящей работы была оценка генетического разнообразия тополей, растущих на терри-тории города Москвы, с использованием высокопроизво-дительного секвенирования внутренних транскрибируе-мых спейсеров генов 45S рРНК (ITS-последовательностей). На платформе Illumina (MiSeq) проведено секвенирование ITS-по следовательностей 40 растений тополя и в среднем получено около 3 000 прочтений для каждого образца. Биоинформатиче ская обработка данных проведена с использованием программы CLC Genomics Workbench. Исследованная выборка тополей имела высокий уровень генетического разнообразия: число выявленных в каждом генотипе однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) от-носительно референсных последовательностей ITS1 и ITS2 P. trichocarpa варьировало от 4 до 44. Показано, что даже деревья, посаженные на одной территории и, вероятно, в одно время, зна чительно различаются генетически. Можно предположить, что при посадке тополей в Москве исполь-зовался крайне полиморфный растительный материал. Для некоторых сайтов c SNP у одного и того же индивидуума выявлено несколько вариантов нуклеотидов, соотношение которых было различным. Мы предполагаем, что соот-ношение, близкое к 50/50, наблюдается в межвидовых гибридах и является следствием генетических различий в ITS-по следовательностях между материнским и отцовским Poplars are widely used in landscaping of Moscow due to the ability to effectively purify the air from harmful impurities and to release a large amount of oxygen. The genus Populus is characterized by a high level of intraspecies polymorphism, as well as the presence of natural interspecies hybrids. The aim of our work was to evaluate the genetic diversity of poplars, which are growing on the territory of Moscow city by high-throughput sequencing of internal transcribed spacers of 45S rRNA genes (ITS sequences). Sequencing of ITS of 40 poplar plants was performed on Illumina platform (MiSeq) and about 3 000 reads were obtained for each sample in average. Bioinformatics analysis was performed using CLC Genomics Workbench tool. The involved set of poplars had a high level of genetic diversity -the number of single nucleotide polymorphisms (SNPs) detected in each genotype relative to the reference ITS1 and ITS2 sequences of P. trichocarpa varying from 4 to 44. We showed that even trees which had been planted on the same territory and, probably, at the same time had significant genetic differences. It can be speculated that highly polymorphic plant material was used for planting poplars in Moscow. For some sites with SNPs, several variants of nucleotides were found in the same individual and the ...