Studi Proteomik pada Protein Otot Rangka Rattus norvegicus Menggunakan Spektrometri Massa Resolusi Tinggi

Abstract

Analisis proteomik bertujuan untuk memperoleh informasi mengenai ekspresi protein seluler. Oleh karena fungsi penting protein dalam organisme hidup, proteomik memainkan peran penting dalam memahami sistem dan proses biologi. Metode paling umum untuk identifikasi protein dalam proteomik adalah menggunakan Mass Spectrometer (MS). Secara lebih spesifik, instrumen MS yang digunakan dalam analisis proteomik adalah Spektrometri Massa Resolusi Tinggi, yang mampu menganalisis massa eksak suatu ion molekuler. Dalam penelitian ini dilakukan hidrolisis sampel protein otot rangka Rattus norvegicus dengan menggunakan enzim tripsin untuk mendapatkan gambaran mengenai proses analisis proteomik. Hidrolisis protein dilakukan dengan variasi enzim:substrat 1:25 (b/b). Hasil hidrolisis kemudian diidentifikasi dengan menggunakan Spektrometri Massa Resolusi Tinggi. Berdasarkan hasil analisis, terdapat 219 protein yang terindentifikasi. Hasil fragmentasi setiap peptida protein menunjukkan kesesuaian dengan fragmen teoritis secara in silico. Hal ini mengindikasikan bahwa identifikasi peptida menggunakan Spektrometri Massa Resolusi Tinggi mampu memberikan hasil yang akurat, sehingga dapat menghindari keraguan dalam identifikasi protein yang kompleks. Hasil ini juga menunjukkan bahwa Spektrometri Massa Resolusi Tinggi memungkinkan screening target peptida dan identifikasi peptida dari matriks protein seluler.