A região sudoeste do Paraná faz parte de uma matriz econômica predominantemente agrícola e pecuária. Diante desse contexto, torna-se importante realizar o diagnóstico e monitoramento da qualidade da água para garantir a saúde pública e a sustentabilidade das atividades locais. Este estudo teve como objetivo avaliar a qualidade da água de poços superficiais em áreas rurais e urbanas em relação à genotoxicidade, utilizando o teste Allium cepa. Bulbos de A. cepa foram expostos às amostras de água coletadas em sete pontos, sendo cinco em áreas rurais e dois em áreas urbanas. Foram incluídos controles positivos com nitrato de chumbo e controles negativos com água destilada. Posteriormente, as raízes foram analisadas para identificar possíveis danos cromossômicos. Os resultados apontaram indícios de citogenotoxicidade e genotoxicidade nas amostras de água analisadas.