Esta investigación tiene como objetivo general analizar el acoso escolar en el rendimiento académico de estudiantes de secundaria en Ecuador. En este estudio participan 390 estudiantes de la provincia de Santo Domingo de los Tsáchilas, los cuales 270 (69,2%) corresponden a unidades educativas públicas y 120 (30,8%) a unidades privadas. Siguiendo la metodología, se utilizó el test de Acoso Escolar (Oñate y Piñuel, 2005) y un test de rendimiento académico basado en las pruebas “Ser Bachiller” del MINEDUC. Para la tabulación de la información se utilizó el Programa Estadístico aplicado a las Ciencias Sociales, SPSS: versión 25. Los resultados demostraron que el acoso escolar influye negativamente con el rendimiento académico, las dimensiones nivel de acoso, intensidad del acoso, restricciones a la comunicación y robos provocan disminución del rendimiento académico en mayor medida en las instituciones públicas. Sin embargo, en las instituciones privadas se incorporan la coacción, las agresiones y robos como variables que inciden negativamente. Como conclusión más significativa, en el análisis predictivo de rendimiento académico se observa una mayor repercusión de la restricción de comunicación en instituciones públicas y un mayor nivel de intensidad de acoso en las instituciones educativas privadas, lo cual genera un impacto negativo en la comunidad educativa.