Wheat non-specific lipid transfer protein genes display a complex pattern of expression in developing seeds

Boutrot, Freddy; Guirao, Anne; Alary, Rémi; Joudrier, Philippe; Gautier, Marie‐Françoise

doi:10.1016/j.bbaexp.2005.06.010

Cited by 64 publications

(69 citation statements)

References 56 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Nonspecific LTPs constitute a family of proteins present in up to 50 plant species [3] and are divided into two subfamilies: nsLTP1 ($ 9 kDa) and nsLTP2 ($ 7 kDa). [4,5] NsLTP1 proteins from various sources are well characterized whereas the structure and functions of nsLTP2 are still poorly understood. [4] For this reason, ' 'nsLTP' ' is commonly used as synonymous with ' 'nsLTP1,' ' convention also followed here.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Computational study of ligand binding in lipid transfer proteins: Structures, interfaces, and free energies of protein‐lipid complexes

et al. 2012

View full text Add to dashboard Cite

Plant nonspecific lipid transfer proteins (nsLTPs) bind a wide variety of lipids, which allows them to perform disparate functions. Recent reports on their multifunctionality in plant growth processes have posed new questions on the versatile binding abilities of these proteins. The lack of binding specificity has been customarily explained in qualitative terms on the basis of a supposed structural flexibility and nonspecificity of hydrophobic protein-ligand interactions. We present here a computational study of protein-ligand complexes formed between five nsLTPs and seven lipids bound in two different ways in every receptor protein. After optimizing geometries in molecular dynamics calculations, we computed PoissonBoltzmann electrostatic potentials, solvation energies, properties of the protein-ligand interfaces, and estimates of binding free energies of the resulting complexes. Our results provide the first quantitative information on the ligand abilities of nsLTPs, shed new light into protein-lipid interactions, and reveal new features which supplement commonly held assumptions on their lack of binding specificity.

show abstract

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Computational study of ligand binding in lipid transfer proteins: Structures, interfaces, and free energies of protein‐lipid complexes

et al. 2012

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…LTPs appear as multigenic families with complex expression patterns. 7,9 In Arabidopsis thaliana at least 15 genes were originally detected using a stringent criterion 10 but later the putative LTPs has been described to reach up to 50 in number. 7 Several roles have been proposed for LTPs 1 even if the conclusive demonstration of the function of individual isoforms is barely documented.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

On the role of a Lipid-Transfer Protein. Arabidopsis ltp3 mutant is compromised in germination and seedling growth.

Pagnussat

Oyarburo

Cimmino³

et al. 2015

Plant Signaling & Behavior

View full text Add to dashboard Cite

“…Зо-крема, нами було показано, що під дією СК і ЯК підвищується рівень експресії гена дефензину сосни (PsDef1) [3]. З літератури відомо, що ЯК індукує експресію LTP у арабідопсису, рису, перцю, пшениці, капусти, льону, а СК, у свою чергу, мала здат-ність індукувати експресію LTP у рису, арабідопсису, тютюну та льону [4,12,13,25,26,28]. Протилежний ефект дії цих гормонів на рівень експресії ліпідтрансферного протеїну ми спостерігали після обприскування ними проростків сосни.…”

Section: Rpl44unclassified

“…Для кожного гена характерний складний профіль експресії, з чітко вираженою тканинною та органоспецифічністю, який залежить від стадії онтогенетичного розвитку рослинного організму і може змінюватися під впливом абіотичних та біотичних стресових чинників [4,12,13,26,30]. Експресія LTP виявлена в насінні, стручках, листках, стовбурах, пагонах, фруктах, квітках і коренях різних видів рослин.…”

unclassified

Patterns of expression of lipid-transfer protein gene in organs of Scots pine (Pinus sylvestris L.)

2012

View full text Add to dashboard Cite

Визначено профіль експресії гена ліпідтрансферного протеїну PsLTP1 (Pinus sylvestris lipid transfer protein 1) у вегетативних та генеративних органах сосни зви-чайної (Pinus sylvestris L.) методом полімеразно-ланцюгової реакції зі зворотною транскрипцією (ЗТ-ПЛР). Встановлено, що експресія гена PsLTP1 є тканиноспеци-фічною та змінюється протягом онтогенетичного розвитку. Досліджено вплив фіто-гормонів на рівень експресії PsLTP1 у проростках сосни звичайної.Ключові слова: сосна звичайна, ліпідтрансферний протеїн PsLTP1, експресія. ВСТУПУ ході еволюції рослинні організми розвинули багаторівневу систему захисту від потенційних патогенів. Одним із компонентів цієї системи є велика група сполук із антимікробними властивостями: фітоалексини, фітоантисипіни, протеїни, пов'я-зані з патогенезом (PR-протеїни) і антимікробні пептиди (АМП). За просторовою структурою та характерним розташуванням залишків цистеїну в молекулі АМП рослин поділяються на декілька родин: дефензини, тіоніни, ліпідтрансферні про-теїни (LTP), циклотиди, снейкіни, гевеїни та кнотини [5,10].Однією із груп АМП рослин, для якої властивий широкий спектр біологічної активності, є ліпідтрансферні протеїни. Молекула LTP рослин характеризується невеликим розміром (7-9 кДа), позитивним зарядом і специфічним мотивом із восьми залишків цистеїну. Третинну структуру LTP формують чотири α-спіральні ланцюги, які стабілізовані дисульфідними зв'язками, та довгий С-кінцевий сегмент. Спіральні ділянки з'єднані між собою рухливими петлями і утворюють гідрофобну кишеню, яка забезпечує взаємодію LTP з жирними кислотами та фосфоліпідами. Ліпідтрансферні протеїни рослин, на відміну від гомологічних їм протеїнів тварин, володіють низькою специфічністю до ліпідів, за що отримали назву "неспецифічні ліпідтрансферні протеїни -нсLTP" [2,13,17].Встановлено, що LTP регулюють внутрішньоклітинний міжмембранний тран-спорт ліпідів, а також залучені до процесів ембріогенезу, росту і розвитку рослин, Biol. Stud. 2012: 6(2);

show abstract

Wheat non-specific lipid transfer protein genes display a complex pattern of expression in developing seeds

Cited by 64 publications

References 56 publications

Computational study of ligand binding in lipid transfer proteins: Structures, interfaces, and free energies of protein‐lipid complexes

Computational study of ligand binding in lipid transfer proteins: Structures, interfaces, and free energies of protein‐lipid complexes

On the role of a Lipid-Transfer Protein. Arabidopsis ltp3 mutant is compromised in germination and seedling growth.

Patterns of expression of lipid-transfer protein gene in organs of Scots pine (Pinus sylvestris L.)

Contact Info

Product

Resources

About