The chemical syntheses of novel digoxigenin-derivatized compounds are described which are modified substrates for enzymatically or photochemically non-radioactive digoxigenin labeling of nucleic acids. Various activated digoxigenin-haptens are coupled to 5-aminoallyl-substituted 2'-deoxyuridine-5'-triphosphate. This results in digoxigeninmodified nucleoside triphosphates of variable spacer lengths (Dig-[4]-dUTP/Dig-[ll]-dUTP/Dig-[16]-dUTP) which can be used as substrates for enzymatic labeling of DNA with digoxigenin-haptens by Klenow enzyme-catalysed random-primed synthesis. In addition the synthesis of N-, a photoactivatable analog of digoxigenin, is described which can be applied for photolabeling of DNA and RNA with digoxigenin-haptens leaving the nucleic acid molecules intact.
Nicht-radioaktiveMarkierung und Detektion von Nucleinsäuren: IV. Synthese und Eigenschaften von Digoxigenin-modifizierten 2'-Desoxyuridin-5'-triphosphaten und eines photoaktivierbaren Analogons (Photodigoxigenin) Zusammenfassung: Es werden die chemischen Synthesen von solchen neuen, Digoxigenin-derivatisierten Komponenten beschrieben, die als modifizierte Substrate zur enzymatischen oder photochemischen nicht-radioaktiven Digoxigenin-Markierung von Nucleinsäuren eingesetzt werden können. Verschiedene aktivierte Digoxigenin-Haptene werden an 5-Aminoallyl-substituierte 2'-Desoxyuridin-5'-triphosphate gekoppelt. Es resultieren Digoxigenin-modifizierte Nucleosidtriphosphate mit unterschiedlichen Spacerlängen (Dig-[4]-dUTP/Dig-[ll]-dUTP/Dig-[16]-dUTP), die als Substrate zur enzymatischen Markierung von DNA mit Digoxigenin-Haptenen über die Klenow-Enzym-katalysierte Random-primed-Synthese eingesetzt werden können. Zusätzlich wird die Synthese von yV-[4]-Azidobenzoyl]-;V-[3-O-digoxigenininyl)methylcarbonyl]-l,8-diamino-3,6-dioxaoctan (Photodigoxigenin), einem photoaktivierbaren Analogon von Digoxigenin, beschrieben. Dieses Substrat kann zur Photomarkierung von DNA und RNA mit Digoxigenin-Haptenen angewendet werden; bei dieser Markierungsreaktion bleiben die Nucleinsäu-remoleküle intakt.