<p>En este estudio se emplearon los marcadores moleculares SCAR-SDSP, SCAR T1 y W11, registrados como secuencias específicas, para discriminar el sexo en las plántulas de papaya y validar su efectividad en plantas florecidas en campo. El SCAR-SDSP amplificó una banda de 369 pares de bases en plantas machos y hermafroditas, lo que permitió corroborar los resultados obtenidos con este marcador, desarrollado en Corpoica en un estudio anterior que utilizó genotipos colombianos. Con el uso de los marcadores SCAR T1 y W11 combinados en una sola reacción, se diferenció el sexo de plantas hembras y hermafroditas. En la predicción de sexos, en una muestra ciega utilizando plántulas de dos meses de edad derivadas de semilla comercial, se observó una proporción de 1:1 de hembras:hermafroditas, lo esperado según el patrón de segregación en un cruce entre estos dos tipos de plantas. La amplificación con el marcador SCAR W11 generó una banda de 800 pares de bases en plantas machos y hermafroditas, independientemente del lugar de procedencia de la muestra. Sin embargo, cuando esta banda se secuenció y analizó con el programa BLAST mostró identidad de 98% entre las secuencias de machos y hermafroditas. </p><p> </p><p><strong>Evaluation of SCAR molecular markers to determine sex in papaya plants (<em>Carica papaya </em>L.) </strong></p><p>In this study the molecular markers SCARSDSP, SCAR T1 and W11 -reported as sex discriminators at seedling level-, were used to validate the effectiveness in flowered plants in the field. SCAR-SDSP amplified a band of 369 bp in male and hermaphrodite plants which allows corroborate the results obtained with this marker, developed at Corpoica using Colombian genotypes, in a previous study. With the use of the SCAR T1 and W11 markers combined in one reaction, it was possible to differentiate female and hermaphrodite plants. When the sex prediction was done with a blind sample using two months-old plantlets, from commercial seeds, a ratio of 1:1 female:hermaphrodite was observed, according to the segregation pattern of a cross between these two types of plants. The amplification with the SCAR W11 generated a band of 800 bp in male and hermaphrodite plants, independently of the sample’s place of origin. However, when this band was sequenced and analyzed with the BLAST program, the analysis showed 98% identity between male and hermaphrodite sequence. </p>