A New Missense Mutation Found in the FLNA Gene in a Family with Bilateral Periventricular Nodular Heterotopia (BPNH) Alters the Splicing Process

Abstract

We describe the clinical and molecular evaluation of two patients, mother and daughter (proband), with bilateral periventricular nodular heterotopia (BPNH). The clinical evaluation revealed a more severe phenotype in the proband, with mental retardation and seizures. Imaging studies showed bilateral periventricular nodules in both patients. We identified a novel mutation, c.987G-->C mutation in exon 6 of the Filamin A (FLNA) gene in the genomic DNA of both patients. Complementary DNA (cDNA) sequencing revealed the maintenance of intron 6 in the mutated allele. Bioinformatics analysis indicates that the mutation identified in both patients probably destroyed the intron 6 donor-splicing site, which is likely to introduce a premature stop codon resulting in a truncated FLNA protein. In addition, X-chromosome inactivation studies in DNA of blood cells revealed a skewed pattern in the proband, and real time quantitative polymerase chain reaction (PCR) showed a higher expression of the mutated allele in the proband compared to that of the mother. This variation in expression of the mutated allele may be responsible for the differences in the clinical manifestations observed in both patients.

Estudos genéticos e moleculares em um grande grupo de pacientes com malformações do córtex cerebral

“…O sequênciamento dos produtos de amplificação para o gene FLN1 identificou dois SNPs (single nucleotide polymorphism) não patogênicos já descritos na base de dados do NCBI (National Center Biotecnology Information), IVSV + 519C>G (NCBI, rs4898478) e IVSV + 506C>T (NCBI, rs4898479), além de uma substituição G987C (NCBI, NM 001456) presente em dois pacientes relacionados (mãe e filha) e ausente em 50 indivíduos controles (ver figura na ref. 17). Para o gene LIS1 foram detectadas alterações neutras C1805T (NCBI, rs6628) e IVSVI+ 27C>T (NCBI, rs3213696), além de outras substituições como G1670C (NCBI, NM_000430) que supostamente levaria a troca de uma troca de cisteina para serina na posição 372 da proteína (C372S), G1368C (NCBI, NM_000430) e G1383C (NCBI, NM_000430) que trocam respectivamente um glutamato para um aspartato nas posições 271 (E271D) e 276 (E276D) da proteína, sendo todas as alterações também identificadas em um grupo controle.…”

“…O sequênciamento dos produtos de PCR mostrou a presença da seqüência completa do intron 6 no cDNA dos pacientes (ver figura na ref. 17). Análises com programas de bioinformática mostraram que a manutenção do intron insere um codon de parada prematuro na matriz de leitura do RNAm do gene FLN1.…”

“…Análises com programas de bioinformática mostraram que a manutenção do intron insere um codon de parada prematuro na matriz de leitura do RNAm do gene FLN1. 17 Estudos de inativação do cromossomo X realizados com DNA proveniente de sangue periférico revelaram um padrão de inativação não randômico no probando (filha). 17 O PCR quantitativo em tempo real mostrou uma expressão aumentada do alelo mutante no probando quando comparado com a mãe (ver figura na ref.…”