Poecilia pertapeh é conhecida, exclusivamente, da localidade-tipo, a lagoa Perta-pé, no município de Formosa, estado de Goiás, na porção alta da bacia do São Francisco, Brasil. A Extensão de Ocorrência (EOO) foi calculada em 120 km² e a Área de Ocupação (AOO), em 4 km². Essa lagoa possui uma várzea relativamente preservada, em uma área de propriedade do Exército com intensa atividade agrícola em seu entorno. Portanto, a lagoa pode estar sujeita a eutrofização e contaminação por agrotóxicos, caracterizando uma única localização. Se as estratégias reprodutivas e a estrutura populacional de P. pertapeh forem semelhantes à de outros Poeciliidae, é possível que a espécie ocorra também em corpos hídricos próximos. No entanto, coletas posteriores na região não resultaram em registros adicionais. Portanto, Poecilia pertapeh foi categorizada como Criticamente em Perigo (CR) pelos critérios B1+2ab(iii).