Entwickelt vor über einem Jahrhundert und beliebter denn je, findet die Massenspektrometrie als analytisches Verfahren heute in beinahe allen Bereichen der Naturwissenschaften Anwendung. Entwicklungen in den letzten beiden Jahrzehnten ermöglichten die Erforschung von Proteinen, sogar intakten Proteinkomplexen, und eine ernsthafte Nutzung in der Strukturbiologie. In diesem Aufsatz beschreiben wir die wachsende Bedeutung der Massenspektrometrie und ihrer technischen Spielarten für die Strukturbiologie anhand einer ausführlichen Betrachtung der strukturellen Virologie. Wir gehen auf die Entwicklung der Massenspektrometrie zu einem Werkzeug ein, das einzigartige Informationen über Struktur, Konformation, Topologie, Aufbau und Funktion von viralen Protein(komplex)en liefern kann, was schließlich in der direkten Analyse von intakten Viruskapsiden mit einer Masse von mehreren Millionen Dalton gipfelt. Die Massenspektrometrie wird heute zur Bearbeitung weitreichender Fragen der Virologie genutzt und hilft so z. B. zu klären, wie Viren aufgebaut werden und wie sie mit ihrem spezifischen Wirt interagieren.