Аннотация. В статье представлен новый подход к решению важных практических проблем комплексной отладки, совместного тестирования и анализа времени выполнения версий программных модулей в распределенной вычислительной среде. Эти проблемы возникают в процессе поддержки непрерывной интеграции функционального наполнения (прикладного программного обеспечения) распределенных пакетов прикладных программ (научных приложений). Исследование ориентировано на пакеты, которые используются для проведения крупномасштабных экспериментов, осуществляемых в рамках междисциплинарных исследований, в гетерогенных распределенных вычислительных средах, интегрирующих Grid и облачные вычисления. Научная новизна предложенного подхода заключается в объединении методологии создания распределенных пакетов прикладных программ с современной практикой разработки программного обеспечения на основе его непрерывной интеграции с использованием знаний о специфике решаемых задач. Средства непрерывной интеграции, разрабатываемые в рамках предложенного подхода, существенно расширяют спектр ее возможностей применительно к процессам создания и использования таких пакетов в сравнении с известными инструментами. Фундаментальной основой их функционирования является концептуальная модель, в рамках которой осуществляется спецификация, планирование и выполнение процессов непрерывной интеграции прикладного программного обеспечения с привязкой к конкретным предметным данным и решаемым задачам. Использование разрабатываемых средств на практике ведет к снижению числа ошибок и сбоев прикладного программного обеспечения при разработке и применении пакетов, что, в свою очередь, существенно сокращает время проведения крупномасштабных вычислительных экспериментов и повышает эффективность использования ресурсов гетерогенной распределенной вычислительной среды. Результаты практических экспериментов по применению прототипа системы непрерывной интеграции прикладного программного обеспечения показывают его высокую эффективность.