Across space and time: A review of sampling, preservational, analytical, and anthropogenic biases in fossil data across macroecological scales

A perspective on reconstructing the spatial and temporal patterns of Earth′s biodiversity in deep time

“…由于生物保存为化石的机率低、空间分布 也不均衡, 深时化石记录时空分辨率低, 各个地区采集 的程度差异大, 缺乏可靠的分析方法等因素, 深时生物 多样性研究一直难以与现代精细时空尺度下的生态系 统变化过程进行比较 [2,23] . 然而, 随着化石和地层大数 据积累、多学科交叉、研究范式和方法创新等, 深时 生物多样性研究已不再局限于简单的分时段统计化石 属种数量 [2,24] . 一方面, 新的含有更加丰富信息的化石 数据库正不断完善和加强, 从而使得发展更精细时间 分辨率的分析手段成为可能; 另一方面, 不同时空尺度 上的生物多样性研究更加综合化, 人工智能算法、利 用超级计算机实现并行计算、模型预测等正在快速进 展 [25,26] .…”

“…化石数据的地理分布在很大程度上受到不同的沉 积环境、采样偏差、研究程度差异, 以及其他随机过 程的影响 [24] . 近年来, 部分学者提出传统的时间单位下 的 标 准 化 方 法 可 能 无 法 消 除 空 间 样 本 不 均 一 性 问 题 [75,76] .…”

The nature of science: The fundamental role of natural history in ecology, evolution, conservation, and education

“…Natural history observations provide the foundation for hypothesis development; laboratory and computer simulations distill knowledge of natural phenomena into a set of codified “rules” for testing; and observational research allows for the ground‐truthing and testing of those rules and once again provides new data for robust methodological probing (Tosa et al., 2021 ). Observational research also permits the re‐examination of missing data and sources of analytical bias, providing insight into where knowledge is lacking and models or approaches may be underperforming (Benson et al., 2022 ; Brown et al., 2012 , 2013 ; Nanglu & Cullen, 2023 ). Through these processes, taking the results of experimental research back into natural environments reintroduces the stochasticity and complexity of the true system, allowing for a full evaluation of the designed models.…”