La différenciation et l’homéostasie cellulaires reposent sur des mécanismes élaborés de contrôle de l’expression des gènes, qui permettent aux différents lignages cellulaires d’un organisme d’établir puis de « mémoriser » différents états épigénétiques. Les processus qui contrôlent l’expression des gènes sont centrés sur la chromatine, un complexe composé d’ADN, de protéines histones et d’ARN, dont la structure est finement régulée. Les outils d’ingénierie de l’épigénome permettent d’interférer avec ces processus et de les étudier, révélant la logique des mécanismes de mémoire épigénétique. Cet article présente les principales classes d’outils de modification ciblée de l’épigénome et illustre comment ils peuvent être utilisés afin de mieux comprendre et modifier l’épigénome des cellules, ouvrant la voie à des perspectives thérapeutiques révolutionnaires.