A floresta tropical é extremamente explorada e fragmentada, sendo imprescindível a coleta de sementes nativas, a fim de atender a crescente demanda para sua restauração e manutenção da biodiversidade. Dessa forma, objetiva-se selecionar fragmentos florestais potenciais com maior grau de conservação para a colheita de sementes, via utilização e associação da ecologia da paisagem à lógica Fuzzy. O estudo foi realizado na bacia hidrográfica do rio Itapemirim. Foram realizadas as etapas de seleção e fotointerpretação das imagens; determinação do erro; aplicação dos índices métricos de ecologia da paisagem; aplicação da lógica Fuzzy em aplicativo computacional e validação da metodologia in loco. Foram determinados 7.515 fragmentos florestais, correspondendo a 19,21% da área de estudo, com 89,53% de acertos. Os fragmentos menores que 5 ha são os mais frágeis e possuem risco de extinção, enquanto os maiores que 300 ha possuem menor risco de extinção, mesmo com o aumento da borda. Com a aplicação da lógica Fuzzy, a média ficou entre 0,15, desvio padrão de 0,24 e o coeficiente de variação em 161,73 %. O Cenário 1 (FLONA de Pacotuba) possui 10,25% de famílias, 25,92 % de gêneros e 33,62% de espécies a mais que o Cenário 2 (PEAMA Ifes Campus de Alegre), entre os indivíduos identificados. A associação das técnicas de ecologia da paisagem e lógica Fuzzy possibilitou identificar os fragmentos em maior grau de conservação, com potencial para colheita de sementes florestais.