Aperfeiçoamento de uma técnica para extrair DNA de água do mar e comparação de métodos de extração de DNA na caracterização de uma comunidade bacteriana marinha.

Abstract

Título da Aperfeiçoamento de uma técnica para extrair DNA de água do mar e comparação de métodos de extração de DNA na caracterização de uma comunidade bacteriana marinha. À minha orientadora Irma Nelly Gutierrez Rivera (in memorian), pelos ensinamentos e pelos bons momentos que sempre levarei comigo. Dedico AGRADECIMENTOS À profª Drª Irma Nelly Gutierrez Rivera (in memorian), amiga e orientadora que esteve comigo compartilhando experiências, transmitindo conhecimentos, conselhos e muita força positiva do início até o fim deste trabalho. Ao Prof. Dr. Gabriel Padilla Maldonado pelo aceite em me orientar na fase final deste estudo e por toda ajuda e apoio concedido. Ao Prof. Dr. Rubens Tadeu Delgado Duarte, pelas dicas e sugestões fornecidas, principalmente na reta final deste trabalho. À Drª Claudiana Paula de Souza Sales pela amizade, pelos ensinamentos em microbiologia e biologia molecular e por toda ajuda concedida no desenvolvimento deste estudo. Aos professores da minha banca de qualificação, Dr. Rubens Tadeu Delgado Duarte, Drª. Elisabete José Vicente e Dr. Ricardo Harakava pelas suas valiosas considerações. Ao Prof. Fernando Dini Andreote e ao seu orientado Thiago Gumiere pela orientação na realização e análise dos dados da técnica do DGGE. À minha mãe Rosa Passini e irmã Kátia Passini, pelo amor e incentivo que sempre recebo. Aos meus avós e familiares, por todo carinho e apoio. Especialmente à minha tia Irene (in memorian) e sua filha Kêkê pela ajuda nos primeiros passos dessa caminhada. À minha namorada e aos seus pais, Flávio e Eliane, pelos finais de semana divertidos e relaxantes. Agradeço especialmente à minha namorada Larissa Ortolan Levy, pelo companheirismo, carinho e amor. Você deixou todo esse trabalho mais fácil. Aos bons momentos com meus amigos do laboratório de Ecologia Microbiana Molecular, Claudiana, Bianca, Flávio, Lígia, Nadia, Thiago, Claudia, Gabriel, Caio, e é claro à amiga Vanessa. Ao Seu Lu e à Zita, pelas inúmeras ajudas no laboratório e pelos momentos de descontração.

Comparação de protocolos de extração de DNA em Feijão-Fava (Phaseolus lunatus L.)/ Comparison Of DNA Extraction Protocols In Fava-Beans (Phaseolus lunatus L.)

“…A utilização de nitrogênio líquido na etapa de maceração de tecidos foliares secos, é eficiente no processo de extração, isso porque, o nitrogênio líquido é um forte contribuinte para obter amostra de DNA íntegras, de boa qualidade e ainda acelera a etapa de maceração, o que ajuda a evitar degradação do material genético e diminuir o tempo de exposição das folhas a composto fenólicos (DALBOSCO et al, 2015). Brasileiro (1999), os rastros de DNA degradado, podem se justificar devido a ação de DNAses ou pode ter ocorrido durante a utilização do clorofórmio através da quebra mecânica, que ocorre na etapa de purificação, no qual o clorofórmio é usado para desnaturar as proteínas e ajuda a formar camada interface da fase aquosa e fase orgânica, sendo importante que o pH esteja entre 7,8 a 8,0 para que o DNA permaneça na fase aquosa (PASSINI, 2015).…”