A conservação da biodiversidade emergiu como uma preocupação global em resposta ao agravamento da degradação do habitat, ao desmatamento e às mudanças climáticas. Neste contexto, os marcadores moleculares se destacam como instrumentos cruciais para a compreensão da diversidade genética, estrutura populacional e adaptação das espécies florestais. Este estudo aborda a aplicação desses marcadores como ferramentas essenciais nas estratégias de conservação dessas espécies. A questão central da pesquisa reside na urgência de proteger e preservar a diversidade genética diante das crescentes pressões ambientais e da perda de habitat. Os objetivos deste estudo visam esclarecer como os marcadores moleculares podem ser efetivamente empregados para esse fim. O método de pesquisa adotado inclui uma revisão sistemática da literatura científica em bancos de dados especializados. Os resultados revelam o papel crucial dos marcadores moleculares na conservação de espécies florestais, permitindo a avaliação da diversidade genética, identificação de populações em risco, análise de fluxos gênicos e adaptação ambiental. Além disso, destacou-se a necessidade de uma maior integração entre os dados genéticos e as estratégias de conservação, bem como o desenvolvimento de diretrizes mais robustas para a aplicação dessas ferramentas. Em conclusão, este estudo enfatiza a importância dos marcadores moleculares nas estratégias de conservação de espécies florestais e sublinha a necessidade contínua de pesquisa nessa área para garantir a preservação da biodiversidade florestal em um contexto de mudanças ambientais globais. Em suma, reforça-se a relevância dos marcadores moleculares como aliados fundamentais nas estratégias de conservação de espécies florestais, contribuindo para a proteção da biodiversidade e a sustentabilidade dos ecossistemas florestais em escala global.