RESUMEN: La enseñanza de la Anatomía humana es trascendental para toda profesión del área de la salud. En el contexto de Chile, ésta se caracteriza por ser principalmente corte tradicional con transferencia unidireccional de la información. Actualmente se propone lograr un aprendizaje más significativo, con la ayuda de modelos como Aula invertida. El objetivo de este estudio es comparar el rendimiento académico entre el modelo tradicional (MT) y Aula invertida (AI). Se intervinieron 2 cursos de 1° año, de las carreras de Nutrición y Odontología año 2022 de la Universidad de La Frontera, en los que se aplicó MT y AI, comparando el rendimiento con un test post clase en Nutrición, y un trabajo grupal en Odontología. Se realizaron análisis estadísticos descriptivos y pruebas que compararon las notas obtenidas. En uno de los grupos se segmentaron los estudiantes por rendimiento para analizar cómo afecta cada modelo dependiendo del tipo de estudiante. Se obtuvo mejor promedio post test con AI en Nutrición; 4,9 ±1,3, en contraste con un promedio de 4,2 ±1,3 para MT (escala 1,0 a 7,0). La prueba T de Student arrojó diferencias estadísticamente significativas (p<0,05), y el test ANOVA de bloques dio cuenta de diferencias en los resultados si se utiliza AI, con mejores rendimientos en tal caso. Para Odontología no hubo diferencias significativas (p>0,05) en las calificaciones de los trabajos grupales con MT y AI. Es imperante actualizar la enseñanza de la Anatomía en favor de lograr un aprendizaje significativo, mediado por el trabajo de pares y el estudiante como protagonista que propone AI, que a su vez beneficia a aquellas personas con rendimientos más bajos al comienzo.