Avaliação da biodiversidade de rizóbios simbiontes do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) em Santa Catarina

Abstract

RESUMOOs solos brasileiros, em geral, apresentam uma população abundante de rizóbios capazes de nodular e fixar N 2 em simbiose com o feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.); contudo, a diversidade dessas bactérias ainda é pouco conhecida. Este estudo teve por objetivo conhecer a biodiversidade de microssimbiontes do feijoeiro em Santa Catarina e, para isso, foram obtidos 117 isolados de nódulos de plantas coletadas em campo, em 23 áreas do extremo oeste, do meio oeste e do planalto sul catarinense. Com base nos atributos morfofisiológicos, os isolados foram classificados em nove grupos. Pela análise dos perfis de DNA após a amplificação (PCR) com o "primer" BOX, que codifica regiões conservadas e repetidas do genoma, 107 perfis distintos foram agrupados em um nível final de similaridade de apenas 26,9 %. Os perfis obtidos pela amplificação do gene 16S ribossômico -referência na taxonomia atual de procariotos -seguida pela digestão com três enzimas de restrição (técnica de RFLP-PCR), resultaram em seis agrupamentos principais e cinco bactérias isoladas. As populações consistiram de 17,1 % de Rhizobium tropici, 35,9 % de R. etli, 32,5 % de R. leguminosarum, 1,7 % de R. giardinii e 12,8 % com perfis distintos das espécies descritas de rizóbios de feijoeiro. R. tropici predominou em solos ácidos do meio oeste e do planalto sul, R. leguminosarum não foi detectado no extremo oeste e R. etli ocorreu nas três regiões, essas duas últimas espécies em solos menos ácidos. Os resultados enfatizam a diversidade genética elevada de rizóbios, inter e intra-específica, nos solos catarinenses, inclusive com a indicação de novas espécies.Termos para indexação: biodiversidade, fixação biológica do N 2 , Phaseolus vulgaris, Rhizobium etli, Rhizobium leguminosarum, Rhizobium tropici.(1) Recebido para publicação em fevereiro de 2007 e aprovado em dezembro de 2007.

Biodiversity of rhizobia associated with cowpea cultivars in soils of the lower half of the São Francisco River Valley

“…The groups formed had between 26 % (group D) and 48 % (group C) of similarity. Genetic differences between rhizobium isolates using ARDRA were also observed by Han et al (2008), Stocco et al (2008), Ruiz-Díez et al (2009) and Sui et al (2009).…”

“…trifolii (BR 7606) from R. gallicum (BR 528), which appeared in this group with 100 % similarity between them. Studying the biodiversity of bean symbiont rhizobium, Stocco et al (2008) also found no distinction between R. leguminosarum and R. giardinii using three enzymes (HhaI, HpaII and RsaI). The strains R. galegae (BR 10055) and R. giardinii (BR 529) and isolate 373-6 appeared isolated in this group, with similarities of 42 and 40 %, respectively, with the two subgroups formed.…”

Diversity of new root nodule bacteria from Erythrina velutina Willd., a native legume from the Caatinga dry forest (Northeastern Brazil)

“…Among the cultivated species, studies conducted in Brazil have already examined the genetic variability of rhizobia of legumes such as pigeonpea (Costa et al, 2014), peanuts (Lyra et al, 2013;TorresJúnior et al, 2014), common beans (Stocco et al, 2008), among others. This technique is also used to examine the variability of strains isolated from native plants such as bromeliad (Giongo et al, 2013), wild rice (Fernandes Júnior et al, 2013) and legumes (Granada et al, 2014).…”

“…Phenotypic characterization is the basis of polyphasic taxonomy and, together with molecular techniques, has contributed to an improved understanding of the physiology and genetic diversity of rhizobia (Zerhari et al, 2000;Fall et al, 2008;Rasul et al, 2012). Among the molecular characterization techniques, fingerprinting by means of Box-PCR generated profiles have been used to examine the diversity of diazotrophic bacteria associated with the (Stocco et al, 2008;Costa et al, 2014;Torres-Júnior et al, 2014) and native species (Fernandes Júnior et al, 2013;Granada et al, 2014) from Brazil. This simple and low-cost technique allows the discrimination among several rhizobial isolates and reference strains, making possible a fast fingerprinting and selection of bacterial isolates.…”

Resposta do Feijoeiro Comum à Inoculação com Rizóbio e Suplementação com Nitrogênio Mineral em Dois Biomas Brasileiros

“…A maioria dos solos com histórico de cultivo de feijão contém rizóbios nativos que podem interferir no estabelecimento e na eficácia das estirpes inoculadas, reduzindo as respostas à inoculação (Vlassak et al, 1996;Vargas et al, 2000;Raposeiras et al, 2006 (Mostasso et al, 2002;Raposeiras et al, 2006), na Região Sul Hungria et al, 2003;Stocco et al, 2008) e na Região Sudeste (Soares et al, 2006;Lombardi et al, 2009;Torres et al, 2009). Além dessas estirpes de Rhizobium, grande número de isolados classificados como Sinorhizobium sp.…”