Round-leaf sundew (Drosera rotundifolia L.), family Droseraceae, genus Drosera, is one of a few plant species with a strong antifungal potential. Chitinases of carnivorous plants play an important role in decomposition of chitin-containing cell structures of insect prey. The cell wall of many phytopathogenic fungi also contains chitin, which can be utilized by chitinases, thus round-leaf sundew represents an interesting gene source for plant biotechnology. The purpose of this study was to compare the suitability of 3 different E. coli expression strains (E. coli BL21-CodonPlus® (DE3)-RIPL, E. coli ArcticExpress (DE3)RIL and E. coli SHuffle® T7) for production and isolation of heterologous round-leaf sundew chitinase (DrChit). Results showed that the recombinant protein was successfully expressed in all three strains, but occurred in insoluble protein fraction. To get the DrChit protein into soluble protein fraction some modifications concerning to induction temperatures and concentration of the IPTG inductor were tested. In addition, composition of lysis buffer has been modified with supplementation of strong non-ionic detergents, Triton ® X100 and Tween ® 20, respectively. As these modifications didn't increase the amount of the DrChit protein in soluble fraction, therefore, its isolation under denaturing conditions and subsequent refolding for activity assays is recommended.
AbstraktRosička okrúhlolistá (Drosera rotundifolia L.), rodina Droseraceae, rod Drosera, je jednou z mála rastlinných druhov so silným antifungálnym potenciálom. Chitinázy mäsožravých rastlín zohrávajú dôležitú úlohu pri dekompozícií bunkových štruktúr obsahujúcih chitín z tela chyteného hmyzu. Bunkové steny viacerých fytopatogénnych húb obsahujú chitín, ktorý môže byť využívaný chitinázami, čo robí z rosičky okrúhlolistej zaujímavý genetický zdroj pre rastlinné biotechnológie. Cieľom práce bolo porovnanie vhodnosti použitia 3 rozdielnych expresných kmeňov E. coli (E. coli BL21-CodonPlus® (DE3)-RIPL, E. coli ArcticExpress (DE3)RIL a E. coli SHuffle® T7) pre produkciu a izoláciu heterológnej chitinázy rosičky okrúhlolistej (DrChit). Výsledky ukázali, že rekombinantný proteín bol úspešne exprimovaný vo všetkých 3 kmeňoch, ale vyskytoval sa v nerozpustnej proteínovej frakcii. Aby sa DrChit proteín dostal rozpustnej proteínovej frakcie, boli testované modifikácie teploty indukcie a koncentrácie induktora IPTG. Ďalej bolo modifikované zloženie lyzačného pufru pridaním silných neiónových detergentov, Triton ® X100 a Tween ® 20. Pretože tieto modifikácie nezvýšili množstvo získaného DrChit proteínu v rozpustnej frakcii, je odporúčaná jeho izolácia za denaturačných podmienok a následná obnova štruktúry proteínu.