Objetivo. Evaluar los factores asociados a la calidad percibida en la atención de medicinacomplementaria en el Hospital III de Iquitos, en el año 2016. Materiales y métodos. Estudiotransversal. Se evaluaron a 305 pacientes en la consulta externa del Centro de MedicinaComplementaria (CAMEC) durante el año 2016, mediante el uso del SERVQUAL modificado. Además,se evaluaron posibles factores asociados como la edad, sexo, grado de instrucción, tipo de paciente(nuevo o continuador) o la condición del encuestado (paciente o acompañante). Resultados. Lasatisfacción global fue de 72,9%. La satisfacción por dimensiones fue de un 68,6% de Fiabilidad;72,3% de Capacidad de Respuesta; 77,1% de Seguridad; 73,7% de Empatía, y 73,6% para AspectosTangibles. El sexo y la edad estuvieron relacionados con todas las dimensiones evaluadas (p<0,05) ycon la satisfacción global en el caso de las personas mayores de 58 años. Conclusión. La satisfacciónglobal percibida fue alta, siendo las dimensiones de Seguridad y Empatía las que presentaronmayores porcentajes de satisfacción, encontrándose relación con el sexo y la edad.